CTAB提取植物DNA步驟

2022-11-25 02:18:03 字數 2123 閱讀 7176

一、將冷凍乾燥的樣品用液氮研磨成粉末,轉移到離心管,加入65℃預熱的2ml ctab抽提液,65℃保溫30 min 以上,間或輕搖混勻;12 000 r/min室溫離心10 min,取上清液;

二、加入等體積的苯酚:氯仿:異戊醇(25:

24:1),輕輕混勻15 min以上,12 000 r/min室溫離心10 min,用剪去端部約0.8 cm的1 ml吸頭小心將上層液相轉移至一乾淨的eppendorf管中;加入等體積的氯仿:異戊醇(24:

1),顛倒混勻,12000 r/min 離心5 min 。

三、加入2/3體積( )的-20℃預冷的異丙醇,輕輕搖動5 min,顛倒混勻至有白色絮狀沉澱出現,在4℃下12000 r/min離心l0 min,沉澱出dna,去上清;

四、沉澱用75%乙醇/和0.2mol/l kac洗滌2次,每次12000 r/min室溫離心10 min;

五、加入預冷的無水乙醇,輕輕上下顛倒,l2 000 r/min室溫離心20 min,棄乙醇,自然晾乾;加入200μl 去離子水,輕輕敲打使沉澱溶解;

六、加入l μl 10 mg/ml rnase 37℃水浴,保溫l h,去除rna;

dna 提取物於-20℃冰箱貯藏備用.

一、母液配製方法

1、1m tris-hcl 1l配製量

配製方法稱量121.1g tris 置於1l燒杯中。

加入約800ml的去離子水,充分攪拌溶解。

按下表量加入濃鹽酸調節所需要的ph值。

ph值濃鹽酸

7.470ml

7.660ml

8.042ml

將溶液定容到1l。高溫高壓滅菌後,室溫儲存。

注意:應使溶液冷卻後加調定ph值,因為tris溶液的ph值隨溫度的變化差異很大,溫度每公升高1℃,溶液的ph值大約降低0.03個單位。

2、5m nacl 配製量 1l

配製方法稱取292.2gnacl置於1l 燒杯中,加入約800 ml的去離子水後攪拌溶解加去離子水將溶液定容到1l 後,適量分成小份,高溫高壓滅菌後,4℃儲存。

3、0.5m edta 配製量 1l

配製方法稱取186.1g na2edta.2h2o,置於1l 燒杯中。

加入約800ml的去離子水,充分攪拌。

用naoh調節ph值至8.0(約20g naoh)(注意:ph值至8.0時edta才能完全溶解)加去離子水將溶液定容至1l。適量分成小份後,高溫高壓滅菌。室溫儲存。

二、ctab緩衝液配製方法

ctab緩衝液1000ml終濃度

tris-hcl (1mol/l ph8.0100ml100m mol/l

nacl (5mol/l280ml1.4mol/l

edta (0.5mol/l ph8.040ml20m mol/l

ctab20g2% (w/v)

加去離子水將溶液定容至1l。高溫高壓滅菌後,室溫儲存。

計算方法:溶質守恆,溶質的質量在溶液稀釋前後不發生改變。

100m mol/l=0.1 mol/l

20m mol/l =0.02 mol/l

w/v表示質量-體積百分比

ctab法是一種快速簡便的提取植物總dna的方法,

其原理是:採用機械破碎植物細胞,然後加入ctab分離緩衝液將dna溶解出來,再經氯仿-異戊醇抽提除去蛋白質,最後得到dna。

ctab法的版本有很多,不過大同小異。以下是我使用的方法:

1.將植物組織洗淨,用75%的酒精表面消毒4-5min,用去離子水沖洗3次;

2. 將樣品放在滅過菌的研缽中,加入液氮搗碎,迅速轉入1.5ml離心管中,加入600mlctab(或同時加入石英砂和ctab研磨,然後轉入1.5ml離心管中);

3. 65℃水浴1h(每20min反轉搖勻一次);

4. 加等體積的氯仿-異戊醇(體積比24:1),或加入苯酚:氯仿:異戊醇(25:24:1),顛倒混勻;

5. 6500rpm離心30min,取上清於新管中;

6. 重複4,5步驟;

7. 向上清中加入2倍體積的無水乙醇(或2/3體積的異丙醇)沉澱dna,-20℃放置20min或更長時間,或過夜;

9. 加75%的乙醇清洗dna,每次12000rpm 2min,去上清;

10. 風乾後加入40ul的te緩衝液溶解dna;

11. 取2ul溶液電泳檢測。

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