質粒DNA的提取及電泳檢測

2023-02-09 12:15:02 字數 2217 閱讀 4185

一實驗目的

通過本實驗學習掌握鹼裂解法提取細菌質粒dna。

二實驗原理

1. 細菌中有兩種dna,即染色體dna和質粒dna。

2. 質粒dna的提取方法有三種:鹼裂解法,煮沸法,去汙劑(如triton和sds)裂解法。

3. 鹼裂解法比較劇烈,可破壞鹼基配對,使宿主細胞dna變性,共價閉合環狀dna由於空間纏繞,兩條鏈不會徹底分開。當外界條件到達復性條件時,質粒dna的雙鏈又迅速恢復原狀,而較大的線性染色體dna難以復性。

三實驗材料:轉化後的細菌(含有質粒的大腸桿菌)

四、實驗用具和藥品

1. 實驗用具:

搖床,離心機,移液器及槍頭,玻璃試管(15ml)及塞子,離心管(1.5ml)

2. 實驗試劑:

(1)溶液i

50 mmol/l 葡萄糖

25 mmol/l 三羥甲基氨基甲烷(tris)tris·hcl(ph8.0)

10 mmol/l 乙二胺四乙酸(edta)(ph8.0)

(2)溶液ii

0.4mol/l naoh,2%sds,用前等體積混合

(3)溶液iii 5 mol/l 乙酸鉀 60ml

冰乙酸11.5ml

水28.5ml

(4)te 緩衝液

10 mmol/l tris·hcl(ph8.0)

1 mmol/l edta(ph8.0)

(5)70%乙醇(放-20℃冰箱中,用後即放回)

(6)加樣緩衝液(6x):40%蔗糖、0.25%溴酚蘭

(7)電泳緩衝液:0.045mol/l tris-硼酸 0.001mol/l edta (0.5x tbe buffer)

電泳緩衝液貯存液:5x:54g tris鹼、27.5g硼酸、20ml 0.5mol/l edta(ph8.0)

五實驗步驟

(一)細菌繁殖

挑取白色的單菌落若干,轉移到3ml液體lb培養基(附加100mg/ml amp ),37℃過夜振盪(200r/min)培養。

(二)菌體收集

將過夜培養的菌體轉入1.5ml離心管,離心30sec 5000r/min;棄上清提取質粒

(三)質粒提取

方法一:鹼裂解法提取質粒dna

1..將上述沉澱重懸於250μl冰預冷的溶液ⅰ中,劇烈**;

2.加入250μl溶液ⅱ,蓋緊管口,快速顛倒離心管5~10次;

3.加入350μl冰預冷的溶液ⅲ,蓋緊管口,溫和地顛倒離心管5~10次;9000r/min離心5min上清轉移到另一新1.5ml離心管中;

4.加等體積氯仿,振盪混合,靜置, 9000r/min離心5min,上清轉移到另一新1.5ml離心管中;

5.加入1/10體積3mol/l的醋酸鈉和2倍體積的乙醇,充分混勻,靜置5min;9000r/min離心5min;

6.棄上清,用70%ethanol洗滌;

7.加30μlte溶解,-20 ℃儲存。

方法二:試劑盒提取方法

1.離心收集的菌體中加入含rnaase的溶液ⅰ250μl,重懸菌體,不應留有小的菌塊;

2. 加溶液ⅱ250μl,輕輕顛倒離心管4-6 次,使菌體充**解,至溶液澄清;

3. 加入350μl冰預冷的溶液ⅲ,溫和並充分地上下翻轉混合6-8 次;

4. 12000r/min離心10min;

5. 將上清轉移到dna結合管(置於2 ml 離心管中),12000r/min離心1min,棄濾液;

6. 將製備管置回離心管,加入去蛋白試劑500μl,12000r/min離心1min,棄濾液;

7. 將製備管置回離心管,加洗滌液700μl,12000r/min離心1min,棄濾液;以同樣的方法再用700μl洗滌液洗滌一次,棄濾液。

8. 將製備管置回2 ml 離心管中,12,000×g 離心1 min,去除殘餘的洗滌液;

10 將dna結合柱放入另乙個新的1.5ml離心管中,在製備管膜**加60-80μl洗脫液或去離子水,室溫靜置1 min。12,000×g 離心1 min。

(四)檢測提取dna質量的電泳檢測。

● 取4ul質粒dna+2ul加樣緩衝液+6ul ddh2o;

● 配製1%的瓊脂糖凝膠

● 電泳30min,eb染色,拍照。

注意事項:氯仿對眼睛、**、粘膜及呼吸道都有刺激作用,它是致癌劑並可損傷肝臟和腎臟,操作時需戴手套、口罩。

六實驗作業

1. 思考本實驗的關鍵步驟是什麼?

2. 瓊脂糖電泳鑑定質粒dna時,能看到幾條帶,快慢順序是什麼?

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