經濟合同管理過程中存在的問題分二個階段：一是合同簽訂階段;二是合同的履行階段。
1.合同的簽訂階段
(1)合同主體不當。合同當事人主體合格，是合同得以有效成立的前提條件之一，而合格的主體，首要條件應當是具有相應的民事權利能力和民事行為能力的合同當事人。這裡要防止兩種傾向：
一是雖然具有上述兩種能力，但不是合同當事人，即當事人錯位，也是合同主體不當;二是雖然是合同當事人，但卻不具有上述兩種能力，同樣是合同主體不當。
(2)合同內容不嚴謹。不嚴謹就是指不準確及不全面，容易引起歧義和誤解，導致合同難以履行或引起爭議。訂立合法和有效的經濟合同，應當體現雙方的真實意思。
不能只講正面的，不講反面，如果不清楚簽合同應當本著「先小人後君子」的原則，那麼一旦發生違約情況則難以處理。
(3)無效合同。《合同法》第52條規定，違反法律、行政法規的強制性規定簽訂的合同屬於無效合同，而無效合同是不受法律保護的，如果經濟合同以合法的形式掩蓋其非法目的的，實質也是無效合同。
2.在合同履行階段
(1)合同變更沒有及時履行。合同變更包括合同內容變更和合同主體的變更兩種情形。合同變更的目的是通過對原合同的修改，保障合同更好履行和一定目的的實現，為了維護單位自身的合法權益，變更要及時有效。
(2)沒有及時辦理鑑證確認。履約過程中的鑑證是一種正常行為，但如果不給予足夠的重視，則當發生糾紛時，會因無法舉證而敗訴。
(3)忽視了具有法律效力的證據。應該清楚並不是所有書面證據都具有法律效力，有效的證據應當是原件的、與事實有關的、有蓋章和(或)簽名的、有明確內容的和未超過期限的。不具備法律效力的書面證據只是廢紙一張。
二、加強經濟合同管理的策略
合同關係自始至終是一種法律關係，因此合同管理也應當是自始至終的全過程的、全方位的管理，合同管理應做好以下幾方面的工作：
1.建立健全經濟合同管理制度
要使合同管理規範化、科學化、法律化，首先要從完善制度入手，制定切實可行的合同管理制度，使管理工作有章可循。合同管理制度的主要內容應包括：合同的歸口管理，合同資信調查、簽訂、審批、會簽、審查、登記、備案，法人授權委託辦法，合同示範文字管理，合同專用章管理，合同履行與糾紛處理，合同定期統計與考核檢查，合同管理人員培訓，合同管理獎懲與掛鉤考核等。
建立和健全單位的合同管理制度，必須根據我國的《合同法》和相關的法規，同時結合單位的實際情況。
2.加強合同管理人員的繼續教育工作
合同管理人員的業務素質的高低，直接影響著合同管理的質量。首先要加強對各級管理人員合同法規的宣傳教育，促進各級管理人員特別是領導者和決策者轉變不合時宜的思維和模糊認識，增強法制觀念和風險意識。然後依照合同管理人員應具有的素質條件，選擇本單位的優秀人才擔任合同管理人員，也可以通過公開考評和競爭招聘方式選拔人員，堅持優勝劣汰的原則，把優秀人才放在這個崗位上。
人員確定之後，要加強合同管理人員的繼續教育工作，可根據本單位與市場的實際情況，參加短期培訓或進相關高校深造。同時從經濟角度出發，對合同管理人員實行崗位責任制，明確他們的責、權、利，建立競爭機制，對有貢獻的單位領域和合同管理人員給予獎勵。通過以上措施，促進合同管理人員的思想水平、法制水平和業務能力的不斷提高。
3.違約糾紛的及時處理
合同關係是一種法律關係，違約行為是一種違法行為，要承擔支付違約金、賠償損失或強制履行等法律後果。法律顧問部門審查合同時選擇合適的違約條款和糾紛處理條款顯得很重要，一旦發生違約情形，法律顧問要區別情況，及時採用協商，仲裁或訴訟等方式，積極維護單位的合法權益，減少單位的經濟損失。
4.加強監控，防範合同履行中存在的風險
合同管理經濟合同的管理
第一條本公司對經濟合同實行二級管理 專業歸口制度，法人委託書制度，合同專用章制度及基礎管理制度。第二條本公司經濟合同的二級管理具體是 公司由總經理總負責凡管副總經理 總經理助理 具體負責，歸口管理管理部門為法律顧問室。下屬公司一級由經理 副總理負責，歸口管理人為辦公室主任或秘書 各法人委託人具體負責...
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