實驗室常用實驗方法

2023-01-22 19:42:03 字數 3580 閱讀 5494

總rna的提取(trizol法提取)

在收集到生物材料之後,最好能即刻進行rna製備工作。若需暫時儲存,則應以液氮將生物材料急速冷凍後,儲存於-80℃冷凍櫃。在製備rna時,將儲存於冷凍櫃的材料取出,立即以加入液氮研磨的方式打破細胞,不可以先行解凍,以避免rnase的作用。

1. 提取組織rna時,每50~100mg組織用1ml trizol試劑對組織進行裂解;提取細胞rna時,先離心沉澱細胞,每5-10 ╳106個細胞加1ml trizol後,反覆用槍吹打或劇烈振盪以裂解細胞;

2. 將上述組織或細胞的trizol裂解液轉入ep管中,在室溫15~30c下放置5分鐘;

3. 在上述ep管中,按照每1ml trizol加0.2ml氯仿的量加入氯仿,蓋上ep管蓋子,在手中用力**15秒,在室溫下(15℃~30℃)放置2~3分鐘後,12000g(2℃~8℃)離心15分鐘;

4. 取上層水相置於新ep管中,按照每1ml trizol加0.5ml異丙醇的量加入異丙醇,在室溫下(15℃~30℃)放置10分鐘,12000g(2℃~8℃)離心10分鐘;

5. 棄上清,按照每1ml trizol加1ml 75%乙醇進行洗滌,渦旋混合,7500g(2℃~8℃)離心5分鐘,棄上清;

6. 讓沉澱的rna在室溫下自然乾燥;

7. 用rnase-free water 溶解rna沉澱

pcr實驗室常用dna聚合酶有三種:takara taqtm,takara extaqtm和pyrobesttm dna polymerase。takara taqtm是一般的dna聚合酶,保真性較差,但價錢便宜,一般用於基因表達的檢測等。

takara extaqtm是具有proof reading活性的耐熱性dna聚合酶,具有一定的保真性,而且其擴增得到的pcr產物3』端附有乙個「a」鹼基,如果希望直接將產物轉殖到t-vector可以用此酶。pyrobesttm dna polymerase也是具有proof reading活性的耐熱性dna聚合酶,其特點是保真性極高,擴增得到的pcr產物為平滑末端。如果進行基因的擴增請使用此酶。

1. 按下列組成在pcr反應管中調製反應液:

takara taqtm或takara extaqtm的配方

pyrobesttm dna polymerase的配方

1 反應總體積根據實際情況進行調控,可以做20~50l以節約試劑;

2 將上表各成分加入到0.2ml或0.5ml滅菌的pcr薄壁管中;

3 如果不用pcr儀的加熱蓋,在反應混合液的上層加30 ~50l 的礦物油防止樣品在pcr的過程中蒸發;

2. 按以下程式進行pcr擴增。

pcr反應條件視模板、引物等的結構條件不同而各異,在實際操作中需根據具體的情況以及pcr結果而進行優化。

反應結束後,抽取擴增樣品5l,用瓊脂糖凝膠電泳分析擴增結果,用dna marker判斷擴增片段的大小或冷凍儲存,以備以後分析使用。

rt-pcr

protocol: takara one step rna pcr kit (amv)

1. 按下列組成在pcr反應管中調製反應液

1. 反應總體積根據實際情況進行調控,可以做20~50l以節約試劑;

2. 將上表各成分加入到0.2ml或0.5ml滅菌的pcr薄壁管中;

3. 如果不用pcr儀的加熱蓋,在反應混合液的上層加30 ~50l 的礦物油防止樣品在pcr的過程中蒸發;

2. 按以下條件進行反應

反應結束後,抽取擴增樣品5l,用瓊脂糖凝膠電泳分析擴增結果,用dna marker判斷擴增片段的大小或冷凍儲存,以備以後分析使用。

瓊脂糖核酸電泳

1. 用蒸餾水將制膠模具和梳子沖洗乾淨,放在制膠平板上,封閉模具邊緣,架好梳子;

2. 根據欲分離dn**段大小用凝膠緩衝液配製適宜濃度的瓊脂糖凝膠:準確稱量瓊脂糖乾粉,加入到配膠用的三角燒瓶內,定量加入電泳緩衝液(一般20~30 ml);

3. 放入到微波爐內加熱熔化。冷卻片刻,加入一滴螢光染料,輕輕旋轉以充分混勻凝膠溶液,倒入電泳槽中,待其凝固;

4. 室溫下30~45分鐘後凝膠完全凝結,小心拔出梳子,將凝膠安放在電泳槽內;

5. 向電泳槽中倒入電泳緩衝液,其量以沒過膠面1mm為宜,如樣品孔內有氣泡,應設法除去;

6. 在dna樣品中加入10×體積的載樣緩衝液(loading buffer),混勻後,用槍將樣品混合液緩慢加入被浸沒的凝膠加樣孔內;

7. 接通電源,紅色為正極,黑色為負極,切記dna樣品由負極往正極泳動 (靠近加樣孔的一端為負)。一般60~100v電壓,電泳20~40min即可;

8. 根據指示劑泳動的位置,判斷是否終止電泳;

9. 電泳完畢,關上電源,在凝膠成像儀上觀察電泳帶及其位置,並與核酸分子量標準marker比較被擴增產物的大小。

膠**純化dna

1. 瓊脂糖電泳,將特異電泳帶用刀切下放入到ep管中,稱瓊脂糖帶的重量;

2. 按照每100mg加400l的量加入binding buffer,放入到ep管振盪器中,45℃~55℃溫育振盪,直到所有的瓊脂糖都溶解(大概要5分鐘);

3. 取出純化柱,將上述溶解液轉移至柱中,室溫下放置2分鐘,8,000rpm 離心1分鐘,棄ep管中的液體,將純化柱放回ep管中;

4. 加500l的wash buffer至柱中,8,000rpm 離心1分鐘。棄管中的溶液;

5. 重複操作4步的操作1次,最後將純化柱放入ep管中10,000rpm離心30秒,除去痕量的wash buffer;

6. 將純化柱放入乙個新的ep管。加30~40l h2o或者elution buffer至純化柱膜的**,在37℃或50℃下放置2分鐘,10,000rpm離心1分鐘洗脫dna,將ep管中的dna溶液放在-20℃儲存。

7. 注:若想要不電泳而直接純化dna溶液,只需要在第2步中按100l液量加400l的binding buffer,其餘的步驟不變。

大腸桿菌質粒dna的提取(鹼裂解法)

此方法適用於小量質粒dna的提取提取的質粒dna可直接用於酶切pcr擴增。

1. 取1.5ml細菌培養物於ep管中,4000rpm離心1分鐘,棄上清液,使細菌沉澱盡量乾燥;

2. 將細菌沉澱重懸於用冰預冷的100 l溶液i (50 mmol/l葡萄糖,10 mmol/l edta ph 8.0,25 mmol/l tris-hcl ph 8.

0) 中,劇烈振盪;

3. 加入200 l新配製的溶液ii(0.2 mol/l naoh,1%sds(m/v)),蓋緊ep管口,快速顛倒離心管5次,以混合混合物,確保離心管的整個內表面與溶液ii接觸,不要渦旋,置於冰浴中;

4. 加入150 l預冷溶液iii(每100 ml 的溶液iii中含60 ml 5 mol/l 乙酸鉀,11.5 ml冰乙酸,28.

5 ml h2o),蓋緊ep管口,反覆顛倒數次,使溶液iii在粘稠的細菌裂解物中分散均勻,之後將管置於冰上3~5分鐘;

5. 在最大轉速下離心5min,取上清液於另一新ep管;

6. 用兩倍體積的乙醇室溫沉澱雙鏈dna,振盪混合於室溫放置2分鐘,最大轉速離心5分鐘;

7. 小心吸去上清液,將離心管倒置於濾紙上,以使所有液體都流出,在將附於管壁的液滴除盡;

8. 加1ml 70%乙醇洗滌沉澱,振盪混合,用12,000g離心2分鐘,棄上清,將開口的ep管置於室溫使乙醇揮發,直至ep管中內沒有可見的液體存在(5~10分鐘),用適量的ddh2o溶解;

9. 用0.5l的rnase 37℃溫育5~10分鐘;

分析實驗室用水規格和試驗方法

1.範圍 本標準規定了分析試驗室用水的級別 規格 取樣及貯存 試驗方法和試驗報告。本標準適用於化學分析和無機衡量分析等試驗用水。可根據實際工作需要選用不同級別的水。2.規範引用檔案 下面檔案中的條款通過本標準的引用而成為本標準的條款。凡是註明日期的引用檔案,其隨後所用的修改單 不包括勘誤的內容 或修...

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