一、實驗器具與材料:
1、移液槍:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl
2、吸頭:1ml、200μl、20μl
3、勻漿管:5ml
4、吸頭臺:放置1ml吸頭的乙個,放置20μl吸頭的乙個
5、ep管:1.5ml、0.2ml、100μl
6、試劑瓶:2個60ml的棕色試劑瓶(廣口,帶蓋)
1個125ml的白色試劑瓶(放無水乙醇)
7、量筒:50ml、250ml、500ml
8、容量瓶:250ml、500ml、1000ml
9、試管架:5ml、1.5ml、20μl
10、鹽水瓶:250ml、500ml各2個備用,乙個裝無水乙醇,另乙個裝depc水
11、鋁製飯盒:4個
12、塑料小飯盒:1個
13、大瓷缸:2個
14、錫泊紙:一捲
15、捲紙:2卷
16、三角燒瓶:帶蓋,稍大
二、實驗器具的處理與準備
1、塑料製品:(包括槍頭、ep管、勻漿管等)
先將depc水從容量瓶中倒入瓷缸中,將塑料製品逐個浸泡其中,其中小槍頭需要吸管打入depc水,過夜,然後高壓,再烤乾備用,實驗前將槍頭等放入吸頭臺,再高壓一次(ep管)
2、玻璃製品:泡酸過夜,沖洗乾淨,蒙錫紙烤乾備用(depc水泡)(洗淨後先泡1‰depc過夜,再烤乾)
3、勻漿器:(包括剪刀、鑷子)先洗淨後,再高壓(不需要泡depc)
三、試劑配製:
1、depc水:吸出1ml放在1000ml雙蒸水中配成1‰depc水,放在1000ml容量瓶中靜置4小時備用。
2、75%乙醇:用無水乙醇+depc水配,然後放-20℃儲存(其中depc水需先高壓)
3、異丙醇:放入棕色瓶中
4、氯仿:放入棕色瓶中
5、瓊脂糖
四、幾種緩衝液的配製:
1、電泳緩衝液:
tris 54g
硼酸 27.5g
0.5m edta 20ml? ph8.0
蒸溜水 1000ml
5×tbe (貯存液)
再將5×tbe稀釋10倍成0.5tbe就可以在電泳時使用(即工作液濃度),如取50ml貯存液+450ml水——→500ml工作緩衝液
2、上樣緩衝液:
0.25%溴酚藍
0.25%二甲苯青ff
30%甘油
6×緩衝液,4℃儲存
五、瓊脂糖凝膠的配製:
1、1.0%:
1.0g瓊脂糖+100ml電泳緩衝液,微波爐中火30秒至沸騰,熔化的瓊脂物冷卻至60℃時加入10mg/ml溴化乙錠2.5μl,充分混勻,將溫熱的凝膠倒入已置好梳子的膠膜中,在室溫下放置30-45min後現進行電泳。
2、1.5%:
同上,將瓊脂糖的量改為1.5g
六、需購置的rt-pcr材料:
(生工. tel. 2236106.)
taq酶(含mgcl2 buffer) 200u 70.00
dntp: 1支
oligo(dt)15: 1 od 40.00 promega
m-mlv: 1支 250.00 promega (buffer)
rnasin: 1支 110
—— -20℃
depc 5g 110.00
trizol 100ml/1瓶 invitrogen life technologies
—— 4℃
marker: 10μg 0.2μg/ml 150.00 科威
(1543. 994. 697. 515. 377. 231)
七、引物合成
1、內參照:
gapdh
正義:5′—accacagtccatgccatcac—3′
反義:5′—tccaccaccctgttgctgta—3′
β-actin
正義:5′—cacgatggaggggccggactcatc—3′
反義:5′—taaagacctctatgccaacacagt—3′
2、par-4:
正義:5′—gggacctcggaactcaac—3′
反義:5′—tgtatctgcctgggactg—3′
3、退火溫度計算
2(a+t)+4(g+c)
正反義平均數,再上下波動度(±4℃,或±5℃)
4、引物各合成5 od,每od一瓶分裝好
5、引物稀釋:
加depc水量為(μl)
= ? nmol / od × 管上所標od數×100
是為10p mol / μl 濃度的引物溶液
八、pcr產物電泳
先將1-10μl左右pcr產物,加已點在紙上的溴酸蘭,反覆吸打混勻後進行電泳,一般電流為10ma,電源100v,電泳30分鐘,紫外燈下觀察,滿意的結果掃瞄列印。
九、幾個注意點:
1、逆轉錄的關鍵步驟是立即冰水浴?
2、rt時,先開啟pcr預熱30分鐘。
3、rna抽提前,開啟離心機預冷。
[, , ]
組織100mg
↓加1mltrizol
↓勻漿(要徹底,後轉至ep管)
(組織勻漿量》100mg時分裝1ml/每ep管)
↓顛倒混勻10下,室溫5分鐘
↓加氯仿1/5體積(0.2ml)(必須按總體積的1/5)
↓顛倒混勻10下,室溫5分鐘
↓4℃,離心12000g,15分鐘
↓轉上層水相(約400μl)於另一1.5mlep管中
↓加等體積異丙醇(約400μl),混勻室溫10分鐘
↓4℃,離心12000g,10分鐘
↓棄上清
↓加冰預冷的75%乙醇(用depc水配)1ml
↓4℃離心7500g,5分鐘
↓棄上清,空氣乾燥5-10分鐘(不能完全乾燥)
↓溶於depc水中至20μl(10μl-20μl)
(可在55-60℃水中,<10分鐘助溶)
注:1、rna若用於核酸轉移應溶解於樣本緩衝液中,否則depc溶解
2、細胞組織加trizol勻漿後,可在-60℃放置至少乙個月(甚至可一年以上)
3、rna在75%乙醇中,2-8℃至少可儲存一周,-20℃至少可儲存一年
[, ]
(第一步:逆轉錄反應)
(稀釋10倍後用)
↓混勻,離心,70℃ 5min
↓立即冰水浴,稍離心
↓總體積40μl(20μl)
↓混勻,離心,42℃ 60min
↓95℃ 10min(破壞mlv)
↓4℃儲存
[, ]
(第二步:pcr反應)
總體積20μl(50μl)↓混勻
↓97℃,5分鐘
↓立即冰水浴↓混勻
↓三、電泳:
加1-10μl pcr產物+溴芬蘭(1-2.5μl)混勻,加樣,電泳。
注意:taq酶、m-mlv、rnasin等-20℃儲存,操作時置於冰上。dntp勿反覆凍融。
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