思維方式作為長久穩定並廣泛起作用的思維方法和思維習慣，是影響人們行為、科學乃至民族、文化發展的重要因素。中西方思維方式的差異導致二者對待科學研究的態度和科學研究的方法大相徑庭。簡單而言，中國的科學是一種性理科學，西方的科學是一種智性科學。
從科學研究方法的角度比較中西思維方式的差異主要歸結為以下幾點：
第一，在科學研究中，中國思維關注現象，不太注重本質的分析與探求，這極大地限制抽象思維的發展，限制了科學研究的發展。而西方人崇尚知識，把理性的內在的完整性作為知識的最高標準，要求知識具有結構上的完整性，使得長久以來科學研究的極大進步。
例如在自然科學方面，我們的古人記錄了哈雷彗星四十來次，但沒有人總結它的執行規律，最終讓英國人哈雷獲得了此項發現權；我們早就有類似於血液迴圈的看法，但沒有上公升為理論，最終是英國人哈維奠定了理論基礎；此外，我們有中醫、針灸，但停留在經驗或五行的範圍內，雖形成了自己的特殊的話語體系，但陰陽五行之象徵主義推理與三段式推理等科學理性仍然大異其趣。
愛因斯坦說：西方的科學是以邏輯推理和實驗驗證為基礎的，而中國卻不是走這樣的路。的確，有別於西方智慧型的邏輯型、思辨型、實證型，中國的智慧型是記錄型、描述型、經驗型的，我們有許多彗星、新星、太陽黑子的記錄，我們有無數的實用技術發明，有人甚至列出了古代中國幾千個、幾萬個世界第一，但我們的成果永遠處於能工巧匠式的捕捉現象、經驗的初級發展水平，無論多少年都永遠沒有進步。
第二，在科學研究中，中國思維注重現實，注重實用，在科學研究方面體現出強烈的功利性和務實精神。而西方思維精神是比較超越現實的，西方人對科學的研究是出於一種興趣或好奇心，是一種純粹求知的慾望。
啟示最深的就是老師上課**的《光的故事》，光作為我們身邊最熟悉的事物，以中國式的思維很難想到以此為科學研究物件，**光的真諦；而事實卻是大自然通過這最常見的事物傳遞著它的幾乎所有「秘密」。正是西方思維對於求知的好奇型與純粹性引導著他們進一步探索光的故事，進一步展開對自然、人文、科學、哲學等一系列問題的思索，逐步探求與完善著他們的理論，最終取得了如此豐碩的成果。
第三，在科學研究中，中國傳統思維重視直觀和經驗，滿足於通過直覺得到乙個總體印象，而不作周密的詳細的分析。中國思維重視經驗的積累，中國人以前人的經驗作為生活的基礎，以前人所言所行作為安身立命的準則，而缺乏一種實證精神，所以中國理論科學只有量的積累，沒有質的飛躍。而西方傳統思維方式特別注重理性、推理，崇尚邏輯思維。
西方人要求推導程式的嚴格性和規範化，他們認為只有通過理性才能真正理解事物，認識事物普遍性與本質。
正因為此原因，中西的科技研究形成了顯著差異。中國的科技形態基於人類的原始經驗，而西方的科技形態則是對人類原始經驗的轉折。原始思維研究證明，原始人具有超乎尋常的直覺能力和經驗積累。
中國的方塊漢字和形象思維在一定程度上延續了這種原始經驗，從而形成了中國的科技形態；西方的字母文字和語言思維則在一定程度上割斷了與原始經驗的聯絡，使之另外開闢出一塊天地，從而形成了西方的科技形態。
第四，中國思維方式以整體性為基點把事物作為有機整體，進行籠統的直覺綜合。在科學研究方面表現為習慣於從世界或事物的總體出發，強調研究事物的相互聯絡和整體功能，注重思考錯綜複雜的整體及其過程與關係，而不注重研究事物的內部結構。以這一特徵為基點，就決定了中國人傾向於對事物作抽象的綜合把握，而不是作具體的分析，這種分析的整體綜合，只能是直覺意義上的綜合。
而西方思維方式是以個體性為基點，把複雜的事物分解成簡單的要素，逐個地進行研究，這通過分割與整合的方式極大的促進了科學理論的發展。在西方人看來，世界上的事物就是由個別的物質單元即「始基」組成，萬物的差別是由「始基」的特性所決定的。在統一的世界圖景中，西方人注意發現內在的差別和對立，充分展現了世界的多層次性和矛盾性。
西方人強調個體的間斷性，習慣於從乙個個間斷的個體出發研究，再推而廣之，論及巨集觀世界的萬事萬物。所以西方人強調研究事物的內部結構，認為世界萬物皆由個體組合而成，任何事物都有內在的結構要素和構成的途徑，並由此闡述萬物的形成和變化。個體性這一特點決定了西方科學研究注重分析，力求從紛繁複雜的世界中追求某種純粹的單一元素，並力圖從總體中抽象出某種純粹形式的簡單概念。
在這種思維方式的支配下，西方人對自然界分門別類地研究，這樣可以把隱藏在整體中的重要細節找出來，透過複雜的現象抓住事物的本質。
通過以上分析，可以看出在科學研究與進步方面中西思維方式有著極大的差別。在中國傳統思維的指導下，世界是不可認識或者是認識不完的，所以就不去主動地研究，而是與之保持和諧，把人和自然界看成是乙個互相對應的有機整體，關注的現象是人與自然、人與社會、人與人之間的關係，而不是單純的發展科學理論。而但是科學是建立在對客觀具體事物觀察分析的基礎上，如果按照這種方式去思維，就不會產生科學。
在西方思維方式的支配下，西方人對客觀事物做實證性考察，深入解剖、分析，運用邏輯的歸納、演繹等手段去認識和把握事物的本質和規律。這種思維方式推動了自然科學的迅猛發展，使得長久以來西方處於極其進步的地位。
當然，正如上述分析，我國思維方式依然有其優越性。在21世紀的今天，如何繼承和發揚傳統思維方式的優勢、同時吸收西方思維方式的精華，使中西方科學交匯融合，更加發展進步中國的科學研究是我們努力的方向。
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