清華大學黨委辦公室、校長辦公室（簡稱「兩辦」）是學校黨委和行政的綜合辦事機構。其主要職能是圍繞學校中心工作，積極發揮學校領導的參謀助手、學校的資訊樞紐、部門的綜合協調、決策的督促檢查等作用，服務領導，服務部門，服務基層，做好管理和服務的各項相關工作。兩辦對內合署辦公，設綜合科、秘書科、資訊科。
學校政策研究室、信訪辦公室、規章制度審核辦公室掛靠兩辦。
具體職責包括：
一、負責組織、協調學校重要會議和大型活動，督促檢查學校決策的實施和重要事項的貫徹落實情況。
二、根據校領導的指示和授權，綜合協調黨政各部門、各單位的工作關係及有關事宜。
三、負責開展與上級單位和相關部門的聯絡，組織、協調有關接待工作。
四、負責校領導的秘書工作，協調安排校領導日常活動和聯絡基層工作。
五、負責學校規章制度建設及規範有關工作。
六、負責學校視覺形象識別系統的實施推進工作，規範學校紀念品、禮品以及公共關係用品的管理。
七、負責學校黨委和行政的公文處理及文書歸檔工作。
八、負責全校機要檔案的收發及保密管理工作。
九、負責全校的資訊工作，編髮《清華大學演示文稿》等資訊，編印《清華大學年鑑》等重要資料。
十、負責學校的資料統計、整理、上報及學校資訊公開工作。
十一、負責群眾來信處理、來訪接待工作。協調並督（催）辦各職能部門的信訪工作。
十二、負責學校24小時值班工作，協調應對緊急突發事件。
十三、負責學校黨委和行政的印信管理和使用，負責校內各單位黨政印章的刻製及規範管理。
十四、負責校級授權、學校事業單位法人證書、組織機構**證書的管理。
十五、負責與全校基層單位辦公室的工作聯絡、交流，指導各基層單位辦公室的相關工作，並組織業務培訓。
十六、完成校領導交辦的其他工作。
黨委辦公室職責
一 組織 安排全社黨委召開的各種會議，並認真做好記錄 二 及時傳達黨委書記及上級黨組織的指示 決定 通知，並嚴格按照指示精神貫徹執行 三 負責草擬聯社黨委的決議 工作報告 計畫 總結及其它有關檔案。黨委書記及上級黨組織下發的各類檔案。四 指導基層黨組織建設和黨員教育管理 建立健全各信用社 分社，各部...
黨委辦公室職責
一 及時傳達上級黨組織的指示 決定 通知，並了解貫徹執行的情況，向黨委及上級黨組織匯報，認真做好上情下達，下情上達的工作。二 組織 安排黨委召開的各種會議，並認真做好記錄。三 負責草擬黨委的決議 工作報告 計畫 總結及其它有關檔案。審核以黨委名義上報下發的黨委各職能部門的起草檔案 信函。四 檢查各支...
黨委辦公室工作職責
一 在院黨委領導下，負責宣傳黨和國家的路線 方針 政策和形勢教育工作，宣傳黨委重大決議事項，為醫院改革發展提供精神動力和思想保證，製造良好的 環境。二 負責紀委的日常工作，履行 監督 教育 懲處 保護 的職能。受理對黨組織和黨員違反黨紀的檢舉和控告，受理黨組織和黨員對黨紀處分不服的申訴，保障黨員的民...