分子生物學實驗常規技術操作

2022-11-12 20:09:05 字數 3135 閱讀 8219

1. 質粒提取

1.1 小提質粒

1.2 小量快提質粒鑑定:

1.3 大提質粒:

2. 酶切

2.1 製備型酶切

2.2 小量酶切鑑定

2.3 dn**段5'突出端的補平

3. 瓊脂糖凝膠電泳

4. **

4.1 從低熔點瓊脂糖凝膠中**dn**段

4.2 小量膠**dn**段試劑盒操作(見操作手冊)

4.3 無水乙醇沉澱**

5. 連線

5.1 一般連線

5.2 平端動態連線

6. 轉化

6.1 質粒快速轉化

6.2 連線物轉化

7. 制普通固體培養板

8. 塗板

9. 挑菌

10. 血清中病毒核酸的提取(蛋白酶k法)

哺乳動物細胞單轉殖株分離

常用溶液、培養基配製

1. 質粒提取:

1.1 小提質粒:

本實驗室在常規條件下採用鹼裂解法小量提取質粒

做完實驗請及時收拾實驗台 *

1.2 小量快提質粒鑑定:(目前較少採用)

(1)取培養的菌液1ml,12000rpm 離心30s,收集菌體,在紙上扣幹殘留培養液。

(4)12000rpm 離心10分鐘。

(5)小心吸取5ul上清上樣電泳。(對於插入片段足夠大的重組子,其遷移率應低於未插入片段的對照質粒。)

* 做完實驗請及時收拾實驗台 *

1.3 大提質粒:

(1)從-20℃儲存的甘油菌吸取50ul菌液,接種到3~4ml的lb培養基中,37℃振盪培養至od600為1.6~1.8。

(2)取0.5ml菌液接種到200ml lb培養基中,37℃振盪培養至od600為2.0以上,再加入氯黴素至170ug/ml,37℃繼續振盪培養12~16hr。

(3)將搖好的菌液4000rpm離心15min。

(4)棄上清,敞開離心管口倒置,盡量讓上清全部流盡。

(5)用預冷的40ml ste充分懸浮菌體沉澱。

(6)4℃,4000rpm離心10min。

(7)棄上清,敞開離心管口倒置,讓上清全部流盡。

(8)用預冷的4ml溶液ⅰ充分懸浮菌體沉澱。

(9)加入新鮮配製的溶液ⅱ 8ml,上下顛倒幾次,液體會變得澄清,置於4℃10min。

(10)加入預冷的溶液ⅲ 6ml,上下顛倒混勻後,4℃中放置30min。

(11)4℃,12000rpm離心10min。

(12)收集上清,加等體積的異丙醇,4℃放置30min。

(13)4℃,10000rpm離心10min。

(14)棄上清,用70%的乙醇洗沉澱一次,室溫吹乾,溶於1ml 1×te中。

(15)加50ul rnasea,37℃作用2小時。

(16)加1ml新配製的13%的peg8000溶液(13%peg8000,1.6m nacl),充分混勻,4℃放置30min。

(17)4℃,12000rpm離心15min。

(18)吸去上清,用400ul 1×te溶解沉澱。

(19)加1/4體積4m licl,室溫放置5min,12000rpm離心5min。

(20)取上清,用酚、酚-氯仿-異戊醇各抽提一次。

(21)將水相轉入一新的eppendorf管中,加入1/10體積4m licl,2倍體積的無水乙醇,-20℃放置30min。

(22)4℃,12000rpm離心10min,去上清,70%的乙醇洗沉澱一次,室溫晾乾。

(23)加200ul 1×te溶解沉澱,測定質粒dna的濃度後於-20℃儲存備用。

做完實驗請及時收拾實驗台 *

2. 酶切:

2.1 製備型酶切:

(1)在滅菌過的新0.5ml eppendorf管中加入下列成分混合:

注意:酶切時酶要在最後才加,加酶時要用新的槍頭,動作要迅速,酶不要在空氣中暴露過久;要盡量保持低溫,不要用手直接接觸儲存管上裝酶的部位;用完後要蓋緊放回原處;要用新酶或有問題時請找管理員xxy。

注意:酶切時用酶量不能過大,過大會影響酶切並且可能會有星號效應。引起酶切效果不佳的原因一般多是質粒沒有提好。除個別特殊位點或內切酶外,酶切時間均不宜過長。

* 為了保證酶切效率(至少在75%以上),需選用合適的反應緩衝液,不同公司的酶切反應緩衝液基本上可以通用。但需注意有的要另外加bsa(10×和100×的都有)。

(2)37℃反應3~4小時(可依據所使用酶的需要,選用合適的酶切時間和溫度)。

(3)取1~2ul電泳鑑定。

做完實驗請及時收拾實驗台 *

2.2 小量酶切鑑定

(1)在滅菌過的新0.5ml eppendorf管中加入下列成分混合:

注意:酶切時酶要在最後才加,加酶時要用新的槍頭,動作要迅速,酶不要在空氣中暴露過久;要盡量保持低溫,不要用手直接接觸儲存管上裝酶的部位;用完後要蓋緊放回原處;要用新酶或有問題時請找管理員xxy。

注意:酶切時用酶量不能過大,過大會影響酶切並且可能會有星號效應。引起酶切效果不佳的原因一般多是質粒沒有提好。除個別特殊位點或內切酶外,酶切時間均不宜過長。

注意:做小量酶切鑑定時要盡量選用較為廉價的酶

* 請根據保證酶切效率(至少在75%以上)的需要選用合適的反應緩衝液,不同公司的酶切反應緩衝液基本上可以通用。但需注意有的要另外加bsa(10×和100×的都有)。

(2)37℃反應2~3小時(可依據所使用酶的需要,選用合適的酶切時間和溫度)。

(3)取1~2ul電泳鑑定。

做完實驗請及時收拾實驗台 *

2.3 dn**段5'突出端的補平:

(1)在滅菌過的新0.5ml eppendorf管中加入下列成分混合:

注意:酶要在最後才加,加酶時要用新的槍頭,動作要迅速,酶不要在空氣中暴露過久;要盡量保持低溫,不要用手直接接觸儲存管上裝酶的部位;用完後要蓋緊放回原處;要用新酶或有問題時請找管理員xxy。

(2)37℃反應1小時後,低熔點瓊脂糖凝膠**。

做完實驗請及時收拾實驗台 *

3. 瓊脂糖凝膠電泳:

(1) 製備凝膠:根據需要,在指定的三角瓶中配製50/100ml特定濃度的瓊脂糖凝膠。首先在電子天平上稱取一定量的瓊脂糖粉,倒入指定的三角瓶中,加入100ml1×tae,再加入3~4ul溴化乙錠(eb),混勻,在微波爐中煮化(大約4~5min),混勻後倒入插好樣品梳的凝膠槽中,凝固後備用。

溴化乙錠(eb)有潛在的致癌性,操作時要戴手套,並且注意不要汙染其它操作區 *

分子生物學實驗技術

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