瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA

2023-01-12 21:27:03 字數 1151 閱讀 2260

(agarose gel electrophoresis)

目的和要求

學習和掌握瓊脂糖凝膠電泳的原理和基本操作

實驗原理

1. 瓊脂糖凝膠電泳是最常用的鑑定dna的方法,基本原理與蛋白質電泳相似:簡便易行,只需少量dna

2. 瓊脂糖是一種天然聚合長鏈狀分子,可形成具有剛性的濾孔,凝膠孔徑的大小決定於瓊脂糖的濃度

3. dna分子在瓊脂糖凝膠中泳動時具有電荷效應與分子篩效應,遷移速率與其相對分子質量的對數反相關

4. 瓊脂糖凝膠中的dna可利用螢光染料goodview染色並在在紫外燈照射下觀察

主要試劑和器材

一、試劑

50ⅹtae緩衝液(ph8); 凝膠上樣緩衝液(0.2%溴酚藍,50%蔗糖)

goodview (溴化乙錠eb替代物); 瓊脂糖

二、器材

電泳儀、水平電泳槽、紫外檢測儀

基本操作方法

1. 瓊脂糖凝膠製備:

稱取0.45g瓊脂糖,放入錐形瓶中,加入30ml tae緩衝液,保鮮膜封口,置微波爐加熱至完全澄清透明取出搖勻(瓊脂糖濃度為1.5%);

待凝膠溶液冷卻至50℃(不燙手),加入3ml goodview (終濃度0.5g/ml)

2. 凝膠板製備:

用製膠器將紫外透光凝膠盤固定好,採用水平儀調整平衡使凝膠盤位於同一水平面;

將適宜的梳子垂直架在凝膠盤內槽的一端;

將冷卻至50℃的瓊脂糖凝膠緩緩倒入凝膠盤內槽,厚度適宜(不要有氣泡)

3. 點樣:

待凝膠凝固後,小心取出梳齒,將凝膠盤放入電泳槽內,加入足夠的tae電泳緩衝液,使液面略高出凝膠面;

取5微公升pcr擴增產物,向其中加入1微公升的上樣緩衝液,混勻後用移液器將其加入加樣孔,記錄樣品點樣次序與點樣量

4. 電泳:

接通電泳槽與電泳儀的電源,調節電壓90v,當溴酚藍染料移動到距凝膠前沿1-2cm處,停止電泳

5. 觀察:

在紫外燈下觀察凝膠,有dna處應顯出螢光條帶,記錄電泳結果

注意事項:

1. 倒膠時把握好膠的溫度,不要高於60℃ ,否則溫度太高會使凝膠盤變形

2. 膠一定要凝固好才能拔梳子,方向一定要豎直向上,不要弄壞點樣孔

3. 點樣時槍頭下伸,點樣孔內不能有氣泡

思考題dna在電場中的遷移率取決於哪些因素?

瓊脂糖凝膠電泳

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PCR反應及瓊脂糖電泳實驗報告

2 瓊脂糖凝膠電泳 dna在電廠作用下,可以由電源的負極向正極泳動,泳動的速度與dn 段的長度成負相關,與電壓強度成正比,因此可以分離不同長度的dna。在有dna marker 不同已知鹼基對大小的dn 段的混合物 的條件下,由於不同鹼基大小的dn 段在瓊脂糖凝膠上湧動的速度不同,因此電泳完畢後會出...