瓊脂糖凝膠電泳

2022-12-04 10:21:02 字數 1324 閱讀 5827

農學院生態學系劉文學號:2011205017

一、實驗名稱

二、實驗目的

掌握瓊脂糖凝膠電泳的原理,用於分離和純化dn**段。

三、實驗原理

在ph值為8.0~8.3時,核酸分子鹼基幾乎不解離,磷酸全部解離,核酸分子帶負電,在電泳時向正極移動。

採用適當濃度的凝膠介質作為電泳支援物,在分子篩的作用下,使分子大小和構象不同的核酸分子泳動率出現較大的差異,從而達到分離核酸片段檢測其大小的目的。核酸分子中嵌入螢光染料(如eb)後,在紫外燈下可觀察到核酸片段所在的位置。

四、實驗器材與用具

土壤dna,5×tae緩衝液,瓊脂糖粉,錐形瓶,電爐,移液槍及槍頭,凝膠灌製平台,凝膠樣品梳,直流電源等。

五、實驗步驟

1. 5×tae緩衝液稀釋10倍,配製成0.5×tae工作液待用;

2.稱0.8g瓊脂糖粉,置於200 ml錐形瓶,加100 ml 0.5×tae稀釋緩衝液;

3. 用電爐加熱至瓊脂糖全部熔化,稍涼後加入5μl eb或其替代物;

4. 將膠槽置於水平支援物上,插上樣品梳子;

5. 將冷卻至60℃左右的膠液緩緩倒入膠槽中(注意不要產生氣泡),膠的厚度約4~6mm;

6. 待膠完全凝固後撥出梳子(注意不要損傷梳子底部的凝膠);

7. 將膠槽置入電泳槽中,向槽內加入0.5×tbe至液面恰好沒過膠板上表面;

8. 用微量移液器取5μl dna樣品與1μl(6倍)載樣緩衝液混勻;

9. 取混合物小心加入樣品孔中,同時取dna分子量標準溶液λdna作為對照,加入相鄰樣品孔中;

10. 加完樣後,合上電泳槽蓋,立即接通電源(控制電壓保持在5~10v/cm兩電極之間的距離)(注意:上樣到開始電泳的時間不宜過長, 因為先上的樣品中dna會發生擴散,從而影響電泳效果);

11. 當溴酚藍條帶移動到距凝膠前沿約2cm時(約需45分鐘),關閉電源,停止電泳;

12. 取出電泳膠板,在凝膠成像系統或紫外觀察儀上觀察和照相。

六、實驗結果

(左起:marker、樹木1、樹木2、菜園1、菜園2、樹木2、菜園1、菜園2)

七、注意事項

1.瓊脂糖凝膠的濃度直接影響dn**段的分離效果,一定要根據被分離的片段大小確定合適的瓊脂糖凝膠濃度。

2.在電爐上加熱瓊脂糖一定要充分,保證其完全溶化,時間過長會導致液體蒸發。 3.熔化後的瓊脂糖凝膠一定要冷卻至室溫才能灌注。

4.待凝膠完全凝固才可進行電泳,否則電泳後的dna條帶會扭曲變形。

具有極強的致癌性,配製和使用過程中要特別小心,所有操作均只能在專門的電泳區域操作。也可用核酸染料來代替溴化乙錠,使實驗更為安全。 6.

加樣進膠時不要形成氣泡,需在凝膠液未凝固之前及時清除。

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