竇性心律患者或正常左心耳形態大多呈楔形，少數呈三角形。
房顫時，
1左心耳入口明顯增寬，呈球形或半球形改變，且失去有效的規律收縮，
2心耳壁的內向運動難以引起足夠的左心耳排空，導致血液在左心耳淤積，進而形成血栓的病理基礎。
3另外，左心耳自身的形態特點及其內的肌小梁凹凸不平，易使血流產生漩渦和流速減慢，也是促使血栓形成的條件。
房顫患者左心耳內的血栓形成主要包括自發性顯像（sec）、泥漿樣改變（sludge）及血栓形成（thrombosis）三個階段。
研究發現，在這一過程中，左心耳結構不同程度增大，血流速度及各壁運動速度均降低，血栓形成的危險性逐漸增加，而且隨左心耳不斷增大，其充盈及排空速度逐漸降低，提示左心耳結構與功能變化呈線性負相關。
研究提示，60％的風濕性心臟病房顫患者心源性血栓來自左心耳，非瓣膜病房顫患者中90％以上血栓形成於左心耳。因此，干預左心耳預防房顫患者血栓栓塞，尤其是卒中，具有重要的理論依據和臨床意義。
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