1、病害
銹病：為川貝母主要病害。病源多來自麥類作物。
多發生於5-6月。防治方法：選離麥類作物較遠，或不易被上河風侵襲的地塊栽種；整地時清除病殘組織，減少越冬病源;增施磷鉀肥或降低田間濕度，增強抗病能力;發病初期噴0.
2波美度石硫合劑或97%敵鏽鈉300倍液，亦可用代森銨或退菌特防治。
立枯病：危害幼苗。發生於麥季多雨季節。防治方法：注意排水，調節蔭庇度，陰雨天揭棚蓋；發病前後用1：1：100的波爾多液噴灑。
根腐病：5-6月發生，根發黃腐爛。防治方法：注意排水，降低土壤濕度，拔除病株；用5%石灰水淋灌，防止擴散。
日灼病：病株近地面葉片、葉柄及莖被泥土汙染灼傷壞死，防治方法：及時在雨季來臨前用秸稈碎節覆蓋地塊；發現葉片等被泥土汙染應及時沖洗。
菌核病：被害鱗莖產生黑斑，嚴重時整個鱗莖變黑，其內形成大小不等的黑色菌核，地上部分枯萎。防治方法：
輪作；高畦種植；肥料充分腐熟。發現病株立即拔除，並用石灰消毒病穴，再用50%多菌靈可濕性粉劑1000倍液灌根防止未病植株進一步蔓延。
2、蟲害
金針蟲、蠐螬：4-6月危害植株。防止方法：
用菸葉熬水淋灌(每畝用菸葉2.5公斤，熬成75公斤原液，用時每公斤原液加水30公斤)；或每畝用50%氯丹乳油0.5-1公斤，於整地時拌土或出苗後兌水500公斤灌土防治。
地老虎：咬食莖葉。防治方法：早晚捕捉或用90%晶體敵百蟲拌毒餌誘殺。
野蛞蝓：危害植株。防治方法：人工誘殺、捕殺；可在傍晚用3%石灰水或70～100倍氨水噴灑。
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