SDS PAGE電泳操作規範

2023-01-27 00:18:05 字數 4280 閱讀 2543

聚丙烯醯氨凝膠電泳

一簡介作用原理:聚丙烯醯胺凝膠為網狀結構,具有分子篩效應。它有兩種形式:

非變性聚丙烯醯胺凝膠電泳(native-page)及sds-聚丙烯醯胺凝膠(sds-page);非變性聚丙烯醯胺凝膠,在電泳的過程中,蛋白質能夠保持完整狀態,並依據蛋白質的分子量大小、蛋白質的形狀及其所附帶的電荷量而逐漸呈梯度分開。而sds-page僅根據蛋白質亞基分子量的不同就可以分開蛋白質。該技術最初由shapiro於2023年建立,他們發現在樣品介質和丙烯醯胺凝膠中加入離子去汙劑和強還原劑(sds即十二烷基磺酸鈉)後,蛋白質亞基的電泳遷移率主要取決於亞基分子量的大小(可以忽略電荷因素)。

二作用sds是陰離子去汙劑,作為變性劑和助溶試劑,它能斷裂分子內和分子間的氫鍵,使分子去摺疊,破壞蛋白分子的

二、**結構。而強還原劑如巰基乙醇,二硫蘇糖醇(dtt)能使半胱氨酸殘基間的二硫鍵斷裂。在樣品和凝膠中加入還原劑和sds後,分子被解聚成多肽鏈,解聚後的氨基酸側鏈和sds結合成蛋白- sds膠束,所帶的負電荷大大超過了蛋白原有的電荷量,這樣就消除了不同分子間的電荷差異和結構差異。

sds-page一般採用的是不連續緩衝系統,與連續緩衝系統相比,能夠有較高的解析度。濃縮膠的作用是有堆積作用,凝膠濃度較小,孔徑較大,把較稀的樣品加在濃縮膠上,經過大孔徑凝膠的遷移作用而被濃縮至乙個狹窄的區帶。當樣品液和濃縮膠選tris/hcl緩衝液,電極液選tris/甘氨酸。

電泳開始後,hcl解離成氯離子,甘氨酸解離出少量的甘氨酸根離子。蛋白質帶負電荷,因此一起向正極移動,其中氯離子最快,甘氨酸根離子最慢,蛋白居中。電泳開始時氯離子泳動率最大,超過蛋白,因此在後面形成低電導區,而電場強度與低電導區成反比,因而產生較高的電場強度,使蛋白和甘氨酸根離子迅速移動,形成以穩定的介面,使蛋白聚集在移動介面附近,濃縮成一中間層。

此鑑定方法中,蛋白質的遷移率主要取決於它的相對分子質量,而與所帶電荷和分子形狀無關。

三電泳過程

蛋白質在聚丙烯醯胺凝膠中電泳時,它的遷移率取決於它所帶淨電荷以及分子的大小和形狀等因素。如果加入一種試劑使電荷因素消除,那電泳遷移率就取決於分子的大小,就可以用電泳技術測定蛋白質的分子量。2023年,shapiro等發現陰離子去汙劑十二烷基硫酸鈉(sds)具有這種作用。

當向蛋白質溶液中加入足夠量sds和巰基乙醇,可使蛋白質分子中的二硫鍵還原。由於十二烷基硫酸根帶負電,使各種蛋白質—sds複合物都帶上相同密度的負電荷,它的量大大超過了蛋白質分子原的電荷量, 因而掩蓋了不同種蛋白質間原有的電荷差別,sds與蛋白質結合後,還可引起構象改變,蛋白質—sds複合物形成近似「雪茄菸」形的長橢圓棒,不同蛋白質的sds複合物的短軸長度都一樣,約為18a(1a=10的負十次方公尺),這樣的蛋白質—sds複合物,在凝膠中的遷移率,不再受蛋白質原的電荷和形狀的影響,而取決於分子量的大小由於蛋白質-sds複合物在單位長度上帶有相等的電荷,所以它們以相等的遷移速度從濃縮膠進入分離膠,進入分離膠後,由於聚丙烯醯胺的分子篩作用,小分子的蛋白質可以容易的通過凝膠孔徑,阻力小,遷移速度快;大分子蛋白質則受到較大的阻力而被滯後,這樣蛋白質在電泳過程中就會根據其各自分子量的大小而被分離。因而sds聚丙烯醯胺凝膠電泳可以用於測定蛋白質的分子量。

當分子量在15kd到200kd之間時,蛋白質的遷移率和分子量的對數呈線性關係,符合下式:logmw=k-bx,式中:mw為分子量,x為遷移率,k、b均為常數,若將已知分子量的標準蛋白質的遷移率對分子量對數作圖,可獲得一條標準曲線,未知蛋白質在相同條件下進行電泳,根據它的電泳遷移率即可在標準曲線上求得分子量。

sds-聚丙烯醯胺凝膠電泳經常應用於提純過程中純度的檢測,純化的蛋白質通常在sds電泳上應只有一條帶,但如果蛋白質是由不同的亞基組成的,它在電泳中可能會形成分別對應於各個亞基的幾條帶。sds-聚丙烯醯胺凝膠電泳具有較高的靈敏度,一般只需要不到微克量級的蛋白質,而且通過電泳還可以同時得到關於分子量的情況,這些資訊對於了解未知蛋白及設計提純過程都是非常重要的。

四操作步驟

所需試劑及儀器:

試劑:丙烯醯胺,雙丙烯醯胺,tris-base,temed,sds,過硫酸銨,甘油,溴酚蘭,甘氨酸,dtt,考馬斯亮藍r-250,甲醇,冰醋酸,蛋白marker5只(50ul裝),小牛血清白蛋白10mg。

儀器裝置:電泳儀、槽、板5套;10ml小燒杯10只,微量移液器5把,普通移液器5套,足量濾紙,0.45μm濾器。

母液:1、2m tris-hcl (ph8.8)100ml:

24.2g tris-base,50ml蒸餾水,加入濃鹽酸調ph8.8,最後定容至100ml。高壓滅菌處理。

2、1m tris-hcl (ph6.8)100ml:

12.1g tris-base,50ml蒸餾水,加入濃鹽酸調ph6.8,最後定容至100ml。高壓滅菌處理。

3、10%sds100ml:

10gsds,加入70ml蒸餾水在60℃攪拌溶解,待泡沫消失後,定容至100ml。

4、50%(w/v)甘油100ml:

50ml甘油,50ml蒸餾水,混勻即可。

5、1%(w/v)溴酚蘭(染色)10ml:

100mg溴酚蘭,蒸餾水定容至10ml。

6、0.01mol/l乙酸鈉溶液100ml:

0.139g乙酸鈉溶於100ml蒸餾水中,調ph至5.2。

7、1m dtt20ml:20ml0.01mol/l乙酸鈉溶液溶解3.09gdtt,過濾除菌後分裝成1ml/份,-20℃儲存。

工作液:

1、30%聚丙醯胺母液(a液)實際需要250ml

100ml:丙烯醯胺29g,雙丙烯醯胺1g,去離子水在37℃溶解,

定容到100ml。0.45μm濾器過濾除菌,棕色瓶儲存。ph≤7.0。

2、4×分離膠緩衝液(b液)100ml:

75ml 2m tris-hcl (ph8.8)

4ml 10%sds

21ml蒸餾水

4℃存放。

3、4×濃縮膠緩衝液(c液)100ml:

50ml 1m tris-hcl (ph6.8)

4ml 10%sds

46ml蒸餾水

4℃存放。

4、10%過硫酸銨(d液)5ml:

0.5g過硫酸銨,5ml蒸餾水,0.1m分裝。

5、temed (e液)

5、1×tris-甘氨酸緩衝液1l:

tris-base 3g

甘氨酸 14.4g

sds 1g蒸餾水定容到1l,ph8.3左右。

6、5×上樣緩衝液10ml:

0.5ml 1m tris-hcl(ph6.8)

1ml 1m dtt

2ml 10% sds

1ml 1%溴酚蘭

5ml 50%甘油

0.5ml 蒸餾水

7、考馬斯亮藍染色液1l:

考馬斯亮藍r-250 1.0g

甲醇450ml

冰醋酸 100ml

蒸餾水450ml

8、考馬斯亮藍脫色液1l:

甲醇100ml

冰醋酸 100ml

蒸餾水800ml

步驟:一、組裝模具:

用海綿蘸取少量清潔劑,擦洗乾淨兩塊玻璃板,自來水沖洗3—5遍然後,再用無水乙醇沖洗2遍,晾乾待用。將已清洗乾淨的兩塊玻璃板用封條封嚴。組裝在電泳架上,淺玻璃板朝外(靠近操作者一側),然後固定結實。

(注意:清洗玻璃板時動作要輕柔,切勿劃破玻璃面;清洗乾淨之後,不要用手碰玻璃面。)

二、制膠:

1、配10%分離膠10ml:吸取a液3.3ml,b液2.

5ml,蒸餾水4.2ml,d液100μl,在小燒杯中搖勻,再加入e液10μl,立即混勻並用10ml注射器吸取大約8ml混合溶液,沿著玻璃板之間縫隙左上處,緩慢灌膠,一直到距前玻璃板上沿1.5cm處為止。

(注意:a當凝膠完全浸沒玻璃板底的時候,留意觀察是否漏膠。若漏膠,則立即停止灌膠,重新固定模具之後再繼續。

b灌膠應緩慢進行,避免有氣泡產生)

2、水膜封閉空氣:在分離膠上面小心加入一層蒸餾水,以隔絕空氣,促進凝膠聚合。等待約20—30min,交介面有明顯的折光線,且傾斜模具,交介面不隨之改變,為凝膠凝固良好。

用濾紙小心洗乾水分。

3、配5%濃縮膠5ml:吸取a液0.67ml,c液1.0ml,蒸餾水2.3ml,d液50μl,在小燒杯中搖勻,再加入e液5μl,立即混勻,灌膠,到到前玻璃板上沿即可。

4、插上齒梳,確保無氣泡。等待凝膠完全聚合,約需30分鐘。

5、小心拔出梳子,卸下封條,將玻璃板顛倒放置,使淺玻璃板朝內,固定在電泳架上。將整個電泳架放入電泳槽,在內外槽中倒入電泳緩衝液,內槽液面應在前後玻璃板之間。

三、點樣:

1、吸取20μl蛋白樣品到ep管中,加入4μl上樣緩衝液,混勻,沸水中加熱5min

2、全部樣品上樣,小心不要使樣品漂散。

3、同時吸取蛋白marker10—20μl點樣。

四、電泳:連線好正負極導線,穩壓120v,至溴酚蘭到達分離膠底部。

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