第一章1、概念：
分子生物學 dna重組技術結構分子生物學 「基因」的分子生物學定義：產生一條功能多肽鏈或功能rna所必需的全部核甘酸序列。
2、用你現有的知識解釋dna為什麼是遺傳資訊的載體。
3、關注了解近幾年諾貝爾獎獲得者及其科學發現。
第二章名詞解釋:
dna的c值：c值是一種生物的單倍體基因組dna的總量。
c值矛盾（c value paradox）：c值一般隨生物進化而增加，研究發現某些兩棲類的c值甚至比哺乳動物還大，而在兩棲類中c值變化也很大，這種c值與生物進化（結構和組織的複雜性）矛盾的現象稱為c值矛盾。
岡崎片段
dna的半保留複製（semi-conservative replication）：由親代dna生成子代dna時，每個新形成的子代dna中，一條鏈來自親代dna，而另一條鏈則是新合成的，這種複製方式稱半保留複製。
半不連續複製（semi-conservative replication）： dna複製時其中一條子鏈的合成是連續的，而另一條子鏈的合成是不連續的，故稱半不連續複製。
複製子(replicon)：從複製原點到終點，組成乙個複製單位，叫複製子。
轉座子（transposon）：存在於染色體dna上可自主複製和位移的基本單位。
反轉錄轉座子（retrotransposon）：指通過rna為中介，反轉錄成dna後進行轉座的可動元件。
單鏈接合蛋白(ssbp-single-strand binding protein)：在dna複製過程中，穩定已被解開的dna單鏈，阻止復性和保護單鏈不被核酸酶降解。
dna連線酶: 雙鏈dna中一條鏈有切口，一端是3ˊ-oh，另一端是5ˊ-磷酸基，連線酶可催化這兩端形成磷酸二酯鍵，而使切口連線，不能將兩條游離的dna單鏈連線起來。在dna複製、損傷修復、重組等過程中起重要作用。
拓撲異構酶(dna topisomerase):
拓撲異構酶：使dna一條鏈發生斷裂和再連線，作用是鬆解（消除）負超螺旋。主要集中在活性轉錄區，同轉錄有關。例：大腸桿菌中的ω蛋白。
拓撲異構酶ii：該酶能暫時性地切斷和重新連線雙鏈dna，作用是將負超螺旋引入dna分子。同複製有關。例：大腸桿菌中的dna旋轉酶（gyrase）。
dna 解螺旋酶 /解鏈酶（dna helicase)：
通過水解atp獲得能量來解開雙鏈dna。中的rep蛋白就是解螺旋酶，還有解螺旋酶i、ii、iii。rep蛋白沿前導鏈模板3 』→5』移動，而解螺旋酶i、ii、iii沿滯後鏈模板5 』→3』移動。
判斷:dna複製時在前導鏈上dna沿5』-3』方向合成，在滯後鏈上則沿3』-5』方向合成。（ ）。
dna的複製需要dna聚合酶和rna聚合酶（ ）。
基因組dna複製時，先導鏈的引物是dna，後隨鏈的引物是rna( )。
rep蛋白沿前導鏈模板3 』→5』移動，而解螺旋酶i、ii、iii沿滯後鏈模板5 』→3』移動（ ）。
大腸桿菌dna聚合酶ⅰ主要是對dna損傷的修復；以及在dna複製時切除rna引物並填補其留下的空隙( )。
大腸桿菌dna聚合酶ⅲ是dna複製的主要聚合酶，具有3』-5』外切酶的校對功能，提高dna複製的保真性。（ ）
選擇題利用自己的位點專一重組酶把自己從寄主基因組中的乙個地方移到另乙個地方的遺傳元件叫（ ）
a、啟動子 b、轉座子 c、t-dna d、順反子
原核dna合成酶中（ ）的主要功能是合成前導鏈和岡崎片段
a、dna聚合酶ⅰ b、dna聚合酶ⅱ c、dna聚合酶ⅲ d、引物酶
思考題:
dna聚合酶功能?
以dna為模板的dna合成酶
●以四種脫氧核苷酸三磷酸為底物
●反應需要有模板的指導
● dna的合成需要一段rna鏈作為引物
●反應需要有3-oh存在
●dna鏈的合成方向為5』→3』。
請設計乙個實驗來證明dna複製是以半保留方式進行的？
dna半保留複製的生物學意義?
dna的半保留複製表明dna在代謝合成（複製）上的穩定性，保證親代的遺傳資訊穩定地傳遞給後代。
dna的複製過程（大腸桿菌的dna複製為例）?
1)複製起始複合物識別複製起始位點
2)dna雙鏈的解開。
3)rna引物的合成。
4)dna鏈的延伸。
5)切除rna引物，填補缺口，連線相鄰的dn**段。
轉座作用的遺傳效應?
轉座引起插入突變——插入基因失活
轉座產生新的基因——如果轉座子帶有抗藥性基因，除了造成靶序列dna處的基因插入突變外，同時也使這個位點產生抗藥性。
轉座產生染色體畸變——染色體片段缺失或倒位。
扼要說明細胞中dna修復系統有哪幾種?
1)錯配修復-恢復錯配
2)鹼基切除修復負責切除突變的鹼基。
3)核甘酸切除修復負責修復被破壞的dna
4)dna直接修復負責修復嘧啶二體或甲基化dna。
5)重組修復如果dna的模板受到損傷，複製時就可能造成子代雙鏈的缺陷，重組修復系統負責的就是這種缺陷。
核苷酸切除修復?
1）通過特異的核酸內切酶識別損傷部位。
2）由酶的複合物在損傷的兩邊切除幾個核苷酸。
3）dna聚合酶以母鏈為模板複製合成新子鏈。
4）dna連線酶將缺口連線。
鹼基切除修復?
1)一些鹼基在自發或誘變下會發生脫醯胺，然後改變配對性質，造成鹼基轉換突變如腺嘌呤變為次黃嘌呤與胞嘧啶配對、鳥嘌呤變為黃嘌呤與胞嘧啶配對、胞嘧啶變為尿嘧啶與腺嘌呤配對。
2) 糖甘水解酶識別改變了的鹼基，把鹼基從n-β-糖苷鍵處切下來，在dna鏈上形成去嘌呤或去嘧啶位點，統稱為ap位點。
3) 由ap磷酸內切酶將受損核甘酸的糖甘-磷酸鍵切開。
4) 利用dna聚合酶i切除損傷部位，補上核苷酸。
5)最後由dna連線酶連線。
錯配修復？
1)dam甲基化酶使母鏈位於5』gatc序列中腺甘酸甲基化；甲基化緊隨在dna複製之後進行；根據複製叉上dna甲基化程度，切除尚未甲基化的子鏈上的錯配鹼基。
2)在水解atp的作用下，muts，mutl與鹼基錯配點的dna雙鏈接合，muts-mutl在dna雙鏈上移動，發現甲基化dna後由muth切開非甲基化的子鏈。
3)由dna核酸外切酶切去一部核苷酸直至切去錯配鹼基。
4)由dna聚合酶iii補上缺口。
5)最後由dna連線酶連線。
第三章名詞：
轉錄——遺傳資訊從dna轉移至mrna或其它rna的過程。按著鹼基配對原則在rna聚合酶催化作用下以atp、ctp、gtp、utp為原料，dna特定區段()的一條鏈為模板合成rna。
mrna帽子（cap）：5ˊ端的乙個核苷酸總是7-甲基鳥核苷三磷酸（m7gppp）。mrna 5ˊ端的這種結構稱為帽子（cap）。
編輯（editing）：是指的rna在編碼區發生鹼基的突變、加入或丟失等現象。
rna再編碼（rna recoding）: 在某些情況下有些mrna不是以標準固定的方式被翻譯，可以改變原來的編碼資訊，以不同的方式進行翻譯，將mrna的編碼和讀碼方式的改變稱為mrna的再編碼（rna recoding）。
rna再編碼的兩種情況：在翻譯水平，發生+1或-1移位，稱核醣體程式性+1/-1移位。
在翻譯水平，甚至有的發生核醣體跳過50個核苷酸的情況，稱為核醣體跳躍。
真核生物的mrna加工過程中,5』端加上（ ），在3』端加上（ ），後者由（ ）催化。如果被轉錄基因是不連續的，那麼，（ ）一定要被切除，並通過（ ）過程將（ ）連線在一起。
原核基因啟動子區–10位的（ ）區和–35位的（ ）區是rna聚合酶與啟動子的結合位點，能與σ因子相互識別而具有很高的親和力。
簡答：真核轉錄後加工?
5』端加帽
3』端加polya尾是由腺苷酸聚合酶（腺苷酸多聚酶）催化的。
rna的剪接和rna切割
rna的編輯
rna的再編碼和化學修飾
真核mrna帽子結構功能？
①能被核醣體小亞基識別，促使mrna和核醣體的結合參與mrna翻譯起始；
②m7gppp結構能有效地封閉mrna 5』末端，以保護mrna免受5』核酸外切酶的降解，增強mrna的穩定。
真核mrna多聚腺苷酸尾巴功能?
1)提高了mrna在細胞質中的穩定性。
2)尾巴結合蛋白結合尾巴通過尾巴結合蛋白與帽子結合蛋白相互作用參與翻譯的起始。
基因轉錄控制區增強子特點?
1)對轉錄增強效應明顯（10–200倍）；
2)對轉錄增強效應與其位置和取向無關；
3)大多為重複序列，一般50bp；
4) 對轉錄增強效應有嚴密的組織和細胞特異性，只有特定的蛋白質**錄因子）參與才能發揮其功能。
5)沒有基因專一性。
dna轉錄為rna的基本過程?
1)起始位點的識別：rna聚合酶全酶與啟動子dna雙鏈相互作用並與之相結合的過程。
2)轉錄起始:rna鏈上第乙個核甘酸鍵的產生
3)rna鏈的延伸：σ亞基脫落，rna聚合酶核心酶變構，與模板結合鬆弛，沿著dna模板前移；在核心酶作用下，ntp不斷聚合，rna鏈不斷延長。
4)轉錄終止: rna聚合酶核心酶沿著dna模板前移轉錄終止子序列不依賴rho (ρ)因子的終止轉錄或依賴rho (ρ)因子的終止轉錄。
第四章名詞：
密碼子簡併性（codon degeneracy）
同義密碼子（synonymous codon）
翻譯：指將mrna鏈上的核苷酸序列從乙個特定的起始位點開始，無標點連續、不重疊按每3個核苷酸編碼乙個氨基酸的原則，依次合成一條多肽鏈的過程，翻譯——解碼機制是氨基酸通過trna識讀密碼子，而trna運載正確氨基酸是依賴氨基醯-trna合成酶。核醣體是蛋白質合成的機器(場所)，mrna是蛋白質合成的資訊模板，轉移rna（transfer rna，trna）是運載氨基酸、模板與氨基酸之間的接合體。
此外，在合成的各個階段還有許多蛋白質、酶和其他生物大分子參與。
氨醯-trna合成酶有兩種活性：催化特異氨基酸的α-羧基與trna 3』端腺苷酸核醣基上3』-oh縮水形成酯鍵活性（合成氨基醯-trna）。氨基酸的α-羧基與trna 3』端腺苷酸核醣基上3』-oh酯鍵水解活性（校正裝載錯誤的氨基醯-trna）
分子生物學
清道夫細胞 處理氧化修飾了的膽固醇，不具備膽固醇轉化作用，最終導致膽固醇細胞破裂。2 逆轉錄 以病毒rna為模板，指導含有全部病毒資訊的dna合成過程。3 細胞凋亡 在基因程式性控制下有別於細胞壞死的一種，有規律的自我消亡。4 dna的c值 同種生物基因組dna含量是恆定的，乙個單倍體基因組中的dn...
分子生物學
第一章緒論 一 dna的發現 1928年英國科學家griffith等人發現肺炎鏈球菌使小鼠死亡的原因是引起肺炎。首先用實驗證明基因就是dna分子的是美國著名的微生物學家 ery。1952年，美國冷泉港卡耐基遺傳學實驗室科學家hershey和他的學生chase從事噬菌體侵染細菌的實驗。二 分子生物學簡...
分子生物學
一 名詞解釋 1 基因 能夠表達和產生蛋白質和rna的dna序列，是決定遺傳性狀的功能單位。2 基因組 細胞或生物體的一套完整單倍體的遺傳物質的總和。3 端粒 以線性染色體形式存在的真核基因組dna末端都有一種特殊的結構叫端粒。該結構是一段dna序列和蛋白質形成的一種複合體，僅在真核細胞染色體末端存...