用隨機引物時要去除總rna中的trna rrna, 只保留mrna
如果接下來你的pcr產物是外顯子，就用oligo dt;
如果是內含子或者包括部分內含子，就用random
mrna反轉錄之後的cdna為模板進行pcr，不都是外顯子嗎？內含子在這之前都被剪下掉了。所以不知道「內含子...」這句話是什麼意思，或者有其他的含義，求解！
如果你想要做蛋白表達，就用oligo dt，要是你做的基因包括內含子就用隨機引物嘍。
我最近在用逆轉cdna為模板擴增cds序列（3000bp左右），同時用oligodt和random引物逆轉，結果大多數時候兩者擴增效果是一樣的，少部分情況只有random能擴出目的帶，尤其是中間段和靠近5『端的cds區——這結果基本和網上很多資料相吻合——比如隨機引物更適合cds長的、有二級結構的基因。
顯然是選random primer更好，其實說明書是有寫的啦，原因是rt-pcr逆轉錄是要得到乙個所有的rna的cdna庫，然後再p出你要的「幾個基因」，所以不是每個基因的mrna都是有polya的，很多都是沒有的，microrna，pirna，很多都沒有哦，所以如果你用oligo dt引物，就自然會miss掉很多（確實是很多）的rna，而隨機引物不會有這個問題，用它反轉錄出來的cdna豐度更高，結果更加準確
看你的目的基因的mrna有沒有polya尾巴有的話就用oligodt沒有的話就用隨機引物
一般在反轉錄的時候除了引用特異性引物和oligodt作為反轉錄得到第一條cdna鏈外，運用隨機引物的效果也很好，隨機引物一般有6-10鹼基的寡核苷酸引物，引物的序列是隨機的，也就是說隨機引物是各種引物的混合物，隨機序列的肯能性很多，由於隨機引物可能在一條 mrna 鏈上有多個結合位點而從多個位點同時發生反轉錄，比較容易合成特長的 cdna；現在隨機引物已經商品化， 沒有必要自己合成，直接購買就可以，takara公司就有，我用的挺好的，有兩種： pd(n)6 -含有6個鹼基的隨機序列；pd(n)9-含有9個鹼基的隨機序列，我用的是 pd(n)6。
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