飼料中如果含有毒有害的成分，在養魚的過程中，這些有毒有害的成分就會富集到魚體中，損害魚的健康，引發魚病，部分有毒有害物質排入水域形成養殖水域的汙染。這種體內存在有毒有害物質的商品魚進入市場，便會損害人的健康。因此，為了保證養殖水產品的質量安全，就必須使用無公害飼料。
對此，我國飼料衛生標準（gb 13078—91）和無公害食品漁用配合飼料安全限量（ny5072-2001）作了嚴格規定。
無公害飼料的基本要求是：農藥、化學毒害品、抗生素、致病微生物、黴菌毒素等的殘留量均不得超過國家制定的控制標準。
（一）農藥殘留的控制
性質穩定不容易分解的農藥，如六六
六、滴滴涕等，會長期殘留在農作物中，人和動物食用後有積蓄作用，引起慢性中毒。
我國飼料衛生標準對公尺糠、麥麩、大豆餅、粕、魚粉和魚用飼料中的六六
六、滴滴涕殘留量作了嚴格規定。
（二）化學毒害品殘留的控制
無機砷、鉛、汞、鎘、鉻、氟等無機化學毒害品嚴重損害魚的健康，並有積蓄作用，在魚粉、石粉、磷酸鹽、公尺糠、各類魚飼料中的殘留量受到嚴格限制。
氰化物（在木薯幹、胡麻餅、粕和各類漁用飼料中）、亞硝酸鹽（在魚粉中）、黃麴黴毒素b1 （在玉公尺、花生餅、粕和各類漁用飼料中）、棉酚（在棉籽餅、粕、漁用飼料中）、異硫氰酸酯（在菜籽餅、粕和各類漁用飼料中）、噁唑烷硫酮（在各類漁用飼料中）、多氯聯苯（在各類漁用飼料中）等各種有機毒害物，嚴重損害魚的健康，引發魚病，其殘留量均受到嚴格的限制。
魚油容易酸敗，反映油脂酸敗的油脂酸價在魚油和漁用飼料中作了嚴格限制。
（三）有害微生物的控制
沙門氏桿菌感染魚類會爆發魚病，在飼料中不允許存在，黴菌感染會產生劇毒的毒素，在飼料中有限量要求。
（四）抗生素和獸藥殘留的控制
喹乙醇、興奮劑類、性激素類、氯黴素、硝基呋喃類、催眠鎮靜類、硝基咪唑類等各類抗生素和獸藥在魚飼料中不允許新增。
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