臟象學說將腦的生理病理統歸於心而分屬於五臟，認為心是君主之官，五臟六腑之大主，神明之所出，精神之所舍，把人的精神意識和思維活動統歸於心，稱之曰「心藏神」。但是又把神分為神、魂、魄、意、志五種不同的表現，分別歸屬於心、肝、肺、脾、腎五臟，所謂「五神髒」。神雖分屬於五臟，但與心、肝、腎的關係更為密切，尤以腎為最。
因為心主神志，雖然五臟皆藏神，但都是在心的統領下而發揮作用的。肝主疏洩，又主謀慮，調節精神情志：腎藏精，精生髓，髓聚於腦，故腦的生理與腎的關係尤為密切。
腎精充盈，髓海得養，腦的發育健全，則精力充沛，耳聰目明，思維敏捷，動作靈巧。若腎精虧少，髓海失養，腦髓不足，可見頭暈、健忘、耳鳴。甚則記憶減退、思維遲鈍等症。
腦的功能隸屬於五臟，五臟功能旺盛，精髓充盈，清陽公升發，竅系通暢，才能發揮其生理功能。
心腦相通：「心腦息息相通，其神明自湛然長醒」（《醫學衷中參西錄，癇痙癲狂門》）。心有血肉之心與神明之心，血肉之心即心臟。
「神明之心……主宰萬事萬物，虛靈不昧」（《醫學入門·臟腑》），實質為腦。心主神明，腦為元神之腑；心主血，上供於腦，血足則腦髓充盈：故心與腦相通。
臨床上腦病可從心論治，或心腦同治。
腦肺相繫：肺主一身之氣，朝百脈，助心行血。肺之功能正常，則氣充血足，髓海有餘，故腦與肺有著密切關係。所以，在臨床上腦病可以從肺論治。
腦脾相關：脾為後天之本，氣血生化之源，主公升清。脾胃健旺，燻蒸腐熟五穀，化源充足，五臟安和，·九竅通利，則清陽出上竅而上達於腦。
脾胃虛衰則九竅不通，清陽之氣不能上行達腦而腦失所養。所以，從脾胃人手益氣昇陽是**腦病的主要方法之一。李東垣倡「脾胃虛則九竅不通論」，開公升發脾胃清陽之氣以治腦病的先河。
肝腦相維：肝主疏洩，調暢氣機，又主藏血，氣機調暢，氣血和調，則腦清神聰。若疏洩失常，或情志失調，或清竅閉塞，或血溢於腦，即「血之與氣並走於上而為大厥」；若肝失藏血，腦失所主，或神物為兩，或變生他疾。
腦腎相濟：腦為髓海，精生髓，腎藏精，「在下為腎，在上為腦，虛則皆虛」（《醫碥·卷四》），故腎精充盛則腦髓充盈，腎精虧虛則髓海不足而變生諸症。「腦為髓海……髓本精生，下通督脈，命火溫養，則髓益之」，「精不足者，補之以味，皆上行至腦，以為生化之源」（《醫述》引《醫參》）。
所以，補腎填精益髓為**腦病的重要方法。
對於精神意識思維活動異常的精神情志疾病，決不能簡單地歸結為心藏神的病變，而與其他四臟無關。對於腦的病變，也不能簡單地僅僅責之於腎，而與其他四臟無關。
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