基於金奈米粒子的單倍型遺傳分析方法獲重要進展

2022-11-25 09:24:06 字數 861 閱讀 6731

單核苷酸多型性(single nucleotide polymorphism,snp)以及單倍型(haplotype)分析是後基因組時代研究者廣泛關注的焦點。最近,上海交通大學bio-,相關**已於近日**發表在《自然·奈米技術》雜誌(nature nanotechnology, doi: 10.

1038/nnano.2011.141,該雜誌2023年影響因子30.

306)。

單核苷酸多型性(snp)是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的dna序列多型性,常被用作對基因定位及相關疾病研究的遺傳標記。而單倍型則是單條同源染色體上的變異位點等位基因遺傳資訊的組合,為複雜疾病和遺傳關聯分析、致病基因和致**子的確定,藥效和疾病風險的分析乃至人類起源進化、遷徙的歷史研究等提供了更為完整的基因資訊。現有的單倍型實驗檢測技術由於在通量、選擇性和擴增長度上的侷限基本上很難滿足在人類基因組中進行高通量遺傳分析的要求,因此絕大部分遺傳分析中都必須使用計算機演算法來近似開展單倍型分析。

基於之前已發現的金奈米粒子可以顯著提高pcr擴增過程中選擇性的特性(angew. chem. int.

ed. 2005),上海交通大學bio-x研究院師詠勇課題組與上海應用物理所樊春海(上海交通大學兼職教授)課題組通過密切合作,充分發揮遺傳分析與奈米技術的學科交叉優勢,發展了一種基於金奈米粒子的snp及單倍型分析方法,至少可以在長達34 kb人類基因組片斷中實現高特異性擴增,並獲得清晰的測序圖譜,從而可以實現規模化的單倍型檢測。主要實驗工作由上海交通大學的陳鵬博士與上海應用物理所的潘敦博士共同完成(並列第一作者)。

與此同時,上海交通大學bio-x研究院院長賀林院士對此項工作高度重視並給予了大力支援。該項研究將可能用於複雜性疾病的致病基因、功能變異位點研究,重大疾病分子診斷(包括**某些癌症的風險性),以及藥物個體化**。

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