認定申請工作概括起來大致四部分：明晰規定，熟悉程式，完善材料，網上操作。
明晰規定是指申請企業應當認真研讀《認定辦法》、《工作指引》，結合自身情況認真加以對照，做出是否符合要求或努力方向的準確判斷。
熟悉程式是指申請企業對高新技術企業的認定與享受稅收優惠的程式要清楚明了，不走彎路。
完善材料是指申請企業在認為自己符合認定要求後，要對申請材料進行認真準備，力求完美。
網上操作是指高新技術企業的認定工作已有改變，不再是層級上報材料，而是直接在網上申請和提交材料，申請人和認定人自始至終都可不見。這是審批方式的改革，降低了成本，提高了效率。
一、《認定辦法》所指高新技術企業是，在《國家重點支援的高新技術領域》內，持續進行研究開發與技術成果轉化，形成企業核心自主智財權，並以此為基礎開展經營活動，在中國境內（不包括港、澳、臺地區）註冊一年以上的居民企業。
《認定辦法》第十條給出了六項必須同時滿足的條件。擁有核心自主智財權是第乙個條件，是唯一的「一票否決」的條件——沒有核心自主智財權就不認定。申請企業應當是在近三年內通過一定方式取得了直接作用於其主要產品（服務）的核心自主智財權。
在（三）（四）（五）條件中，還有一些比例要求，也是應當注意的。企業在認真審視自己後，認為符合條件的，就可以具體實施認定申請工作；如果認為暫不符合條件，要找出問題所在，擬定解決辦法，爭取下年的申請。
二、高新技術企業認定程式有五個環節，包括自我評價、註冊登記、準備並提交材料、組織審查與認定、公示及頒發證書。申請企業要完成的是前三項。按照《工作指引》的精神，所有申請材料都應製作成電子版式，以便網上傳遞。
三、材料準備是一項十分重要工作。《工作指引》二（3）列舉了需要提交的材料種類，包括認定申請書，二個鑑證報告，乙個審計報告，以及技術創新活動證明材料。
填寫認定申請書認定申請書由《企業基本資訊表》《企業研究開發專案表》《上年度高新技術產品（服務）情況》《近三年內獲得自主智財權彙總表》《企業年度研究開發費用結構明細表》等5張表組成，在填表時要注意所有的財務資料都來自專項審計報告，要和鑑證報告、審計報告完全一致。《企業基本資訊表》中「近3年內獲得的自主智財權數」一欄所填內容，應與技術創新活動證明材料一一對應並完全吻合：「人力資源情況」欄要注意兩個比例要求，即大專以上學歷的科技人員要佔（申請）當年職工總數30%以上，研發人員佔職工人數10%以上；其他一些文字描述的內容多以資料闡述，少用華麗詞句，注意言簡意賅。
慎選中介機構《工作指引》三（一）1.對中介機構提出了明確的條件，申請企業要注意選擇會計師事務所為合作夥伴，非由註冊會計師簽字出具報告的中介機構是不符合條件。在約定時還應要求其提供營業執照影印件、主管註冊會計師協會出具的近三年經營記錄良好和執業註冊會計師人數的證明，提供職工花名冊；首次合作時，還要了解其熟悉高新技術企業認定政策的程度並做好記錄，確保該事務所符合《工作指引》規定的條件。
在實施審計時，申請企業要注意配合註冊會計師工作，做好介紹和溝通，在不影響客觀公正的前提下，使二個鑑證報告、乙個審計報告最符合認定申請要求。
收集整理好技術創新活動證明材料企業在進行技術創新活動中形成的材料是很多的，要注意日常收集與整理。有些材料是證明成果的，如智財權證書（獨佔許可合同）、生產批文，新產品或新技術證明（查新）材料、產品質量檢驗報告；有些材料是可以驗證過程的，如省級以上科技計畫立項通知、委託科研協議、行業協會技術引數（標準）及企業實際引數（標準）、行業專家對研發工作的評價會議意見，企業進行研發活動時的立項、預算、組織機構、人員配置、其他研發資源的情況等。凡能證明企業實際進行了研發活動並取得一定成果的材料都應收集完整並提交。
四、網上操作申請認定企業在完成前期準備工作後，就可在網上向認定機構提交申請了。申請認定企業登入「高新技術企業認定管理工作網」（填寫《企業註冊登記表》，進行註冊登記。在獲取使用者名稱和密碼後，直接在網上提交準備好的材料。
至此，申請工作就可告段落了。
《認定辦法》《工作指引》明確，高新技術企業在效期三年，到期前三個月內可申請複審。複審相對簡化一些，但複審只有一次，再次申請須走初次認定程式。
那麼，企業在日常工作中，為申請認定高新技術企業還要注意哪些問題呢？
無論是初次認定還是複審，《認定辦法》第十條（四）都是重要內容，而這些內容是不能「趕工」的。日常工作要十分重視這個問題，對一些帶有強制要求的指標，要注意經常測算，做必要的調整，寧可高些，不能少些，多些「曲突徙薪」，少些「焦頭爛額」。
1、研究開發費用的歸集與核算是一項基礎性工作，它不僅關係到申請認定能否通過，還涉及計算企業所得稅時技術開發費的加計扣除問題，對企業的利益有很大的影響。
《工作指引》給了我們一張《研究開發費用結構歸集》樣表，和《企業年度研究開發費用結構明細表》基本相似。在日常核算中，筆者認為，企業可考慮在「管理費用」明細賬下設「研發費用」明細賬，按各「研發專案」歸集核算「內部研究開發投入」和「委託外部研究開發投入」。這樣發生的全部研發費用就在一本賬上反映，把在準備申請認定材料時要做的工作，當成日常事務給做了。
既可以便於申請認定時註冊會計師的審計核對，也有利於計算應納稅所得額時技術開發費的加計扣除，主管稅務機關審核起來也方便。在填寫《企業年度研究開發費用結構明細表》只需抄錄註冊會計師的審計報告即可。
2、人員人工企業應當設有專門的科研人員名冊，一方面便於申請認定時對科研人員比例要求的核對，另一方面，便於在費用歸集時的相互對應。企業應當和科研人員訂有勞動合同，繳納社會保險，強調的是科技人員在企業工作時間每年不低於半年（183天）。在支付科研人員人工時，可以考慮集中製表，保持連續，和勞動合同相一致。
3、折舊費用、無形資產攤銷在研發工作開展後發生的裝置折舊和無形資產攤銷可直接計算，這裡提請注意的是以前購置的，現在用於研發專案的固定資產和無形資產賬務處理。企業可根據批准的「研發專案」立項報告，把「國定資產」和「無形資產」的管理部門調整為研發機構，以便正確計算折舊和攤銷額。
4、設計（規劃）費用、裝備除錯費這些費用往往是發生在企業內部中，沒有多少外來原始憑證，事後很難收集和核實，比如除錯裝置的次數和每次消耗電費、相關技術工人的人工。所以，企業應按內部核算的要求，做好原始記錄和憑證，及時履行審批程式，逐月結算入賬。
5、委託外部研究開發費用
要注意專案成果及與企業主要業務緊密相關是衡量外部研發費用能否計入的重要因素。在簽訂委託合同時，應當特別註明。另外，發生的全部委託外部研發費用在申請認定時只能按80%計算，但在計算加計扣除時則沒有這樣的限制。
《認定辦法》明確高新技術企業的認定不經過主管稅務機關，但賦予了主管稅務機關特別管理權，企業應當注意和主管機關做好溝通。「主管稅務機關在執行稅收優惠政策過程中，發現企業不具備高新技術企業資格的，可以提請認定機構複核。複核期間，可暫停企業享受減免稅優惠。
」所以，在申請認定時，可以請主管稅務機關幫助指導，相關材料也可請他們把把關（稅務機關都設立了納稅人服務中心）。企業在取得資格後應把證書及時告知主管稅務機關，而不要到申報企業所得稅時才拿出來。如果減免稅條件發生變化，應在15日內報告；如果不符合條件，就主動納稅，以免被追繳，承擔滯納金並留下不良記錄。
我們要特別注意的另乙個很重要的方面是，《認定辦法》制定了嚴厲的處罰規則，如果發現企業「在申請認定過程中提供虛假資訊的；有偷、騙稅等行為的；發生重大安全、質量事故的；有環境等違法、違規行為，受到有關部門處罰的」，將「取消高新技術企業資格的企業，並且認定機構在5年內不再受理該企業的認定申請」。應當說這是《認定辦法》的乙個亮點，把稅收管理的調控職能擴大到了社會管理方面，和企業的產品質量、安全生產聯絡起來，把環境保護引入到稅收當中。但對企業而言，要求是很高了。
不僅要保證在依法納稅上的無瑕，還要在企業生產管理上不出大的問題。這恰恰是乙個負責任企業的願望。
如果在申請認定過程及日常工作中，做到以上幾個方面，任何嚴格的稅收管理制度和方法，對我們來說只是保護。
馬永順團隊（159********）特別**一級資質申請，
重大專案審批，科技計畫申報，專案融資
高新技術企業認定申請條件
7 企業所得稅年度納稅申報表 技術開發經費加計扣除明細表 8 提供有關誠信資質證明影印件 納稅信用 財務會計信用 工商評價或具有資質的誠信公司出具的有關誠信資質證明 9 專利或軟體著作權證書影印件 通過各類體系認證的資質證書，需提交影印件。10 上年度經審計的財務報表影印件 資產負債表 利潤表或損益...
高新技術企業認定申請材料
企業名稱 蓋章 通訊位址 企業法定代表人 年度企業註冊承諾書 編號 本企業了解高新技術企業認定相關政策 規定 管理結構和申報認定流程，基於對 高新技術企業認定管理工作網 採用的安全方案 保密措施 網路身份識別和驗證系統的充分信任，自願申請註冊成為 高新技術企業認定管理工作網 的註冊企業，並做出如下承...
申請高新技術企業認定材料清單
一 高企認定申請書 1234512345123112311123123123456781234567 企業註冊登記表 行政部 企業基本資訊 行政部 近三年研發專案情況介紹 技術部 上年度高新產品情況介紹 技術部 附件清單 行政部 企業變更證明 包括 企業名稱 企業法人等變更 企業營業執照副本國稅登記...