委託定向投資的運作模式主要流程：
（1）委託行在受託行開設同業存款賬戶，存入同業資金，簽訂同業存款協議和委託投資協議（抽屜協議），另外再簽訂乙份委託行的投資指令；
（2）受託行按照委託行的指令，以受託行的名義投資於委託行指定的金融資產，包括直接投資信託計畫和定向資管計畫等，也可以投資於間接金融資產，如信託受益權、存單受益權、票據資產等；委託行記為「應收款項類投資」。
圖1：委託定向投資的主流運作模式
對於有些較為激進的受託行，可能將委託行的資金投向受託行自身的融資客戶，在並非委託行指定投向的情況下，受託行需要承擔投資專案的風險。
對於委託行而言，「委託定向投資」的操作模式不占用信貸額度，計入「應收款項類投資」並不會加大存貸比壓力，也不會提公升撥備計提的要求，但是由於對外投資的風險權重為100%，因此並不會帶來資本的節約。
對於受託行而言，如果按委託行指令投資，受託行只發揮通道作用，並收取5‰~8‰的手續費，屬於表外業務，不占用資本，也不承擔風險；如果將同業資金投向與受託行自身的融資客戶，則需要由受託行兜底。
在委託定向投資業務中，可能出現由於抽屜協議的存在，委託行只按照「存放同業」入賬，在委託投資發生時並未在「應收款項類投資」反映，從而導致風險資本占用的降低。
在合規的委託定向投資業務中，運作模式如下：
委託行把資金以100%比例保證金的形式存入受託行，作為同業存款，受託行必須給委託行開具存單憑證，委託行再把存單憑證質押給受託行，受託行再以相同額度的自有資金投向委託行指定的金融資產專案。
在合規模式中，受託行以自有資金投資放貸，需要在表內記為信貸資產，同時按照監管要求計提資本和撥備，等效於委託行借用了受託行的信貸額度。
圖2：委託定向投資合規的運作模式
委託投資協議
甲方 法定位址 法定代表人 帳號 乙方 法定位址 法定代表人 帳號 鑑於 1 甲方需要對中國境內公司所擁有的專案 奧動專案 進行投資 2 乙方願意協助甲方運作相關投資事宜，甲方願意委託乙方 運作相關投資事宜。雙方經過友好協商，就 投資相關事宜達成如下協議，以茲共同信守 一 合作事宜及方式 1.甲乙雙...
委託投資協議
甲方 委託人 乙方 受託人 根據 中華人民共和國合同法 中華人民共和國公司法 及相關法律法規，甲 乙雙方本著相互信任的原則，經協商一致，現就委託投資事宜，自願達成如下協議，以資雙方秉誠履行。一 委託事項 現甲方將該投資款全部委託給乙方管理，以乙方名義對 同信 同心 惠民1號限額特定集合資產管理計畫 ...
委託投資協議
編號 2011 冀委理字第 09 6 號 委託人 甲方 身份證號 住址 受託人 乙方 法定代表人 住址 委託擔保單位 丙方 委託人委託受託人進行投資。投資金額為人民幣元整，委託投資協議期限為個月，委託投資的月利率為 自年月日至年月日止.委託期屆滿前20日內，如雙方有意繼續合作，可重新簽署委託投資協議...