平行志願填報雖然減少了志願填報的風險，但同樣存在風險。
具體表現在以下三方面：
1、投檔而被退檔的風險。雖然教育考試部門從減少投檔而被退檔的矛盾出發把投檔比例定位105%，但是仍有5%的考生投檔後可能會被退檔。退檔的考生，即便是a志願退檔，也將直接進入徵求志願。
這是平行志願填報最大的風險。被退檔的理由大致有：高考分數在所有被投檔該學校考生中偏低；填報專業志願太高，且志願不服從調劑。
當然，如果高校實行「進檔即取」的原則，那麼，只要分數達到投檔線，志願服從調劑，就不會退檔，落榜生將大大減少。
2、定位不準確的風險。舉例來說，某個文科考生，2023年高考填報志願時，預計自己可以考510分左右，於是a志願填報上海交通大學，b志願填報上海外國語大學、c志願填報上海財經大學、d志願填報華東師範大學，可考試下來，總分只有495分，離開d志願華東師範大學的最低投檔分尚有3分差距，第一輪投檔失敗。這就是定位不准所帶來的風險。
3、志願沒有梯度的風險。舉例來說，某位文科考生a志願填報上海外國語大學、b志願填報上海財經大學、c志願填報華東師範大學、d志願填報上海對外**學院，這4所學校2023年的投檔分依次為503分、502分、498分、493分，相差幅度總計不超過10分，學校之間根本沒有拉開梯度，容易因考場發揮等因素，造成一校落榜，其餘3校也沒有機會。
減少以上三方面風險，要求考生在填報志願時，注意四點：
1、準確評價自己的實力，並根據自己的實力，確定最理想報考院校與最不理想報考院校的範圍。把最不理想報考院校作為d志願。
2、重視a志願的選擇，雖然對於考生來說，不能投檔到a志願，還可投檔到以後的志願，但是，如果按實力報考a志願毫無希望，選擇a志願屬於浪費；如果報考a志願有一定希望，考生必須考慮被投檔卻因分數低而退檔的可能，雖然發生這種情況的機率很小，但一旦發生，後果極其嚴重。當然，如果考生對此有心理準備，也不妨嘗試。另外，從興趣角度出發，a志願應該是考生實力和興趣結合最優的學校。
3、在填報志願時，要減少投檔而被退擋的可能。一要填寫服從專業調劑；二要注意專業填報。平行志願願否調劑欄中有5個數字表示自己的意向：
1表示全部願意調劑；2表示全部不願意調劑；3表示除中外合作專業外，其他願意調劑；4表示除醫學類外，其他願意調劑；5表示除農林專業外，其他願意調劑；全部空白也表示不願意調劑。錄取時一律不予調劑。凡填寫的，錄取時不再徵求考生意見。
4、進行合理的志願搭配，增加各志願的有效性。在平行志願填報中，依舊要注意平行志願間的梯度，一方面，不能使前後志願順序顛倒，使後一志願失效；另一方面，不要使前後志願完全「平行」，造成前一志願不能投檔，後一志願也不能投檔。
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